19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0592 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0592  hypothetical protein  100 
 
 
368 aa  756    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.60475  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0720  hypothetical protein  76.63 
 
 
370 aa  581  1.0000000000000001e-165  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1867  hypothetical protein  77.47 
 
 
449 aa  584  1.0000000000000001e-165  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000308254  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1597  hypothetical protein  71.63 
 
 
369 aa  540  9.999999999999999e-153  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.509379 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0611  hypothetical protein  64.56 
 
 
375 aa  494  1e-139  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0811954 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0093  hypothetical protein  48.9 
 
 
361 aa  318  1e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6603  hypothetical protein  37.58 
 
 
338 aa  169  5e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.175733 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05140  hypothetical protein  38.14 
 
 
366 aa  152  1e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1369  hypothetical protein  33.93 
 
 
366 aa  134  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.429385  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4849  hypothetical protein  29.23 
 
 
414 aa  116  5e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.171892  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3719  hypothetical protein  32.73 
 
 
483 aa  85.5  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.637839  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7754  hypothetical protein  32.85 
 
 
466 aa  75.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.904748  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1247  hypothetical protein  26.11 
 
 
560 aa  75.1  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.477424  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1604  hypothetical protein  32.89 
 
 
452 aa  69.7  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.523133 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2547  hypothetical protein  29.41 
 
 
627 aa  68.9  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.256267  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7173  hypothetical protein  31.33 
 
 
580 aa  67.4  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.142604  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3759  hypothetical protein  21.9 
 
 
461 aa  65.9  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5988  hypothetical protein  33.85 
 
 
475 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075136  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3746  hypothetical protein  24.86 
 
 
590 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>