49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0752 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0752  GH3 auxin-responsive promoter  100 
 
 		 502 aa  1043    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00655  putative plant auxin-regulated protein  65.76 
 
 		 484 aa  698    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1713  GH3 auxin-responsive promoter  68.34 
 
 		 507 aa  737    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3685  GH3 auxin-responsive promoter  54.29 
 
 		 502 aa  599  1e-170  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.46637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3419  GH3 auxin-responsive promoter  53.89 
 
 		 504 aa  578  1e-164  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000537388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5651  GH3 auxin-responsive promoter  50.4 
 
 		 507 aa  555  1e-157  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3670  auxin-regulated protein  51.9 
 
 		 504 aa  550  1e-155  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0869  GH3 auxin-responsive promoter  51.1 
 
 		 510 aa  550  1e-155  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1338  hypothetical protein  49.11 
 
 		 508 aa  541  9.999999999999999e-153  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1720  hypothetical protein  50.8 
 
 		 509 aa  521  1e-147  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0190  GH3 auxin-responsive promoter  38.14 
 
 		 495 aa  372  1e-102  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.210438  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1025  GH3 auxin-responsive promoter  37.12 
 
 		 494 aa  357  3.9999999999999996e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02895  putative auxin-regulated protein  36.68 
 
 		 497 aa  352  8e-96  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.380392  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3833  GH3 auxin-responsive promoter  37.8 
 
 		 500 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.723154  normal  0.130127 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3178  GH3 auxin-responsive promoter  36 
 
 		 510 aa  333  6e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2048  GH3 auxin-responsive promoter  36.38 
 
 		 497 aa  326  5e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5924  GH3 auxin-responsive promoter  35.85 
 
 		 500 aa  322  9.000000000000001e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0468  hypothetical protein  34.81 
 
 		 502 aa  321  1.9999999999999998e-86  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2997  auxin-regulated protein  35.14 
 
 		 496 aa  315  9.999999999999999e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0805  auxin-responsive GH3-related protein  34.65 
 
 		 514 aa  293  3e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0949  GH3 auxin-responsive promoter  34.65 
 
 		 514 aa  293  3e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.424251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0144  GH3 auxin-responsive promoter  34.29 
 
 		 522 aa  281  2e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1664  GH3 auxin-responsive promoter  34.24 
 
 		 514 aa  279  1e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.714218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0473  GH3 auxin-responsive promoter  34.58 
 
 		 521 aa  274  3e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1029  GH3 auxin-responsive promoter  35.65 
 
 		 510 aa  273  7e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00063016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2660  auxin-regulated like  34.65 
 
 		 512 aa  270  4e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12318  hypothetical protein  30.77 
 
 		 507 aa  251  2e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0495  GH3 auxin-responsive promoter  30.74 
 
 		 528 aa  251  2e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5682  normal  0.527563 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0118  GH3 auxin-responsive promoter  31.82 
 
 		 508 aa  242  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.086469 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1092  GH3 auxin-responsive promoter family protein  32.59 
 
 		 562 aa  238  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0359437  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1478  GH3 auxin-responsive promoter  32.1 
 
 		 527 aa  228  2e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.173313 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0617  GH3 auxin-responsive promoter  29.88 
 
 		 528 aa  228  3e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2573  GH3 auxin-responsive promoter  31.72 
 
 		 539 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1855  GH3 auxin-responsive protein  31.49 
 
 		 530 aa  218  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1675  GH3 auxin-responsive promoter  23.27 
 
 		 559 aa  104  4e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4770  GH3 auxin-responsive promoter  22.67 
 
 		 581 aa  82  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0973169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2981  GH3 auxin-responsive promoter  33.33 
 
 		 557 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2824  auxin-responsive GH3-related protein  22.03 
 
 		 487 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0537258  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0953  GH3 auxin-responsive promoter  26.56 
 
 		 586 aa  67  0.0000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0561894  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4515  GH3 auxin-responsive promoter  20.71 
 
 		 526 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1542  hypothetical protein  34.09 
 
 		 128 aa  58.9  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2698  GH3 auxin-responsive promoter  21.94 
 
 		 417 aa  50.1  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.797778  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1379  auxin-responsive GH3 protein homolog, putative  20.88 
 
 		 543 aa  48.5  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.250734  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1190  GH3 auxin-responsive promoter  20.74 
 
 		 543 aa  47.4  0.0005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.259231  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0394  GH3 auxin-responsive promoter  27.96 
 
 		 547 aa  46.2  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.20196  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0740  auxin-responsive GH3-related protein  31.03 
 
 		 532 aa  45.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2150  hypothetical protein  29.66 
 
 		 509 aa  44.7  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2176  hypothetical protein  29.91 
 
 		 509 aa  44.7  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1160  hypothetical protein  20.2 
 
 		 543 aa  43.9  0.007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.104088  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>