43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0190 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_02895  putative auxin-regulated protein  65.78 
 
 		 497 aa  702    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.380392  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3178  GH3 auxin-responsive promoter  65.24 
 
 		 510 aa  681    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1025  GH3 auxin-responsive promoter  68.09 
 
 		 494 aa  717    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0190  GH3 auxin-responsive promoter  100 
 
 		 495 aa  1024    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.210438  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2048  GH3 auxin-responsive promoter  57.4 
 
 		 497 aa  616  1e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5924  GH3 auxin-responsive promoter  56.19 
 
 		 500 aa  604  1.0000000000000001e-171  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3833  GH3 auxin-responsive promoter  53.24 
 
 		 500 aa  594  1e-168  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.723154  normal  0.130127 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2997  auxin-regulated protein  55.74 
 
 		 496 aa  585  1e-166  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0468  hypothetical protein  53.14 
 
 		 502 aa  546  1e-154  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0752  GH3 auxin-responsive promoter  38.14 
 
 		 502 aa  372  1e-102  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1713  GH3 auxin-responsive promoter  38.82 
 
 		 507 aa  365  1e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5651  GH3 auxin-responsive promoter  40 
 
 		 507 aa  358  9.999999999999999e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3685  GH3 auxin-responsive promoter  37.83 
 
 		 502 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.46637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0869  GH3 auxin-responsive promoter  39.03 
 
 		 510 aa  355  1e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00655  putative plant auxin-regulated protein  37.14 
 
 		 484 aa  353  2.9999999999999997e-96  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3670  auxin-regulated protein  36.77 
 
 		 504 aa  338  9.999999999999999e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3419  GH3 auxin-responsive promoter  35.57 
 
 		 504 aa  332  1e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000537388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1338  hypothetical protein  34.26 
 
 		 508 aa  324  2e-87  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1720  hypothetical protein  35.07 
 
 		 509 aa  306  8.000000000000001e-82  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0949  GH3 auxin-responsive promoter  34.16 
 
 		 514 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.424251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0805  auxin-responsive GH3-related protein  34.16 
 
 		 514 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0144  GH3 auxin-responsive promoter  34.02 
 
 		 522 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1664  GH3 auxin-responsive promoter  33.61 
 
 		 514 aa  258  1e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.714218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0473  GH3 auxin-responsive promoter  32.8 
 
 		 521 aa  247  3e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1092  GH3 auxin-responsive promoter family protein  32.94 
 
 		 562 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0359437  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2660  auxin-regulated like  33.68 
 
 		 512 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1029  GH3 auxin-responsive promoter  31.63 
 
 		 510 aa  244  3e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00063016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0118  GH3 auxin-responsive promoter  31 
 
 		 508 aa  236  8e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.086469 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12318  hypothetical protein  31.39 
 
 		 507 aa  235  1.0000000000000001e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1855  GH3 auxin-responsive protein  32.73 
 
 		 530 aa  232  1e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1478  GH3 auxin-responsive promoter  31.25 
 
 		 527 aa  226  6e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.173313 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0495  GH3 auxin-responsive promoter  30.6 
 
 		 528 aa  224  3e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5682  normal  0.527563 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2573  GH3 auxin-responsive promoter  32.14 
 
 		 539 aa  206  8e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0617  GH3 auxin-responsive promoter  28.92 
 
 		 528 aa  192  8e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1675  GH3 auxin-responsive promoter  22.5 
 
 		 559 aa  110  5e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2981  GH3 auxin-responsive promoter  24.8 
 
 		 557 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1542  hypothetical protein  40.91 
 
 		 128 aa  82  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0740  auxin-responsive GH3-related protein  29.7 
 
 		 532 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0953  GH3 auxin-responsive promoter  22.68 
 
 		 586 aa  63.5  0.000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0561894  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4515  GH3 auxin-responsive promoter  27.33 
 
 		 526 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4770  GH3 auxin-responsive promoter  35.71 
 
 		 581 aa  57.8  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0973169  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2824  auxin-responsive GH3-related protein  34.62 
 
 		 487 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0537258  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0394  GH3 auxin-responsive promoter  29.76 
 
 		 547 aa  44.7  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.20196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>