17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0554 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0554  hypothetical protein  100 
 
 
70 aa  139  1.9999999999999998e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0552955 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0075  hypothetical protein  42.11 
 
 
66 aa  49.3  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.398237  normal  0.423709 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1076  hypothetical protein  41.94 
 
 
70 aa  47  0.00009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000323708  normal  0.411942 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0282  membrane protein  41.54 
 
 
64 aa  44.3  0.0006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0790  hypothetical protein  40 
 
 
65 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.185376  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2470  hypothetical protein  41.67 
 
 
112 aa  41.6  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0836129 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1943  hypothetical protein  47.22 
 
 
79 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.153284  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0293  hypothetical protein  47.22 
 
 
79 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.984016  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1171  hypothetical protein  47.22 
 
 
79 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0222478  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1163  hypothetical protein  47.22 
 
 
79 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0855  hypothetical protein  47.22 
 
 
79 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1010  hypothetical protein  47.22 
 
 
79 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.652393  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1322  hypothetical protein  47.22 
 
 
79 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.747526  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4493  hypothetical protein  42.31 
 
 
101 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3901  hypothetical protein  39.62 
 
 
65 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4478  hypothetical protein  40 
 
 
65 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1446  hypothetical protein  45.1 
 
 
68 aa  40.4  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.55376  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>