11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0532 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0532  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  320  5e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.019067  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0865  hypothetical protein  49.07 
 
 		 163 aa  157  4e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0818  hypothetical protein  50.92 
 
 		 163 aa  150  8.999999999999999e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.555084  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1165  hypothetical protein  45.1 
 
 		 164 aa  140  8e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1804  signal transduction histidine kinase, LytS  44.76 
 
 		 163 aa  132  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0710  rod shape-determining protein MreD  39.38 
 
 		 164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0572  hypothetical protein  40.49 
 
 		 163 aa  122  2e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.726102  normal  0.420167 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2220  rod shape-determining protein MreD  33.33 
 
 		 166 aa  47.4  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0768  rod shape-determining protein MreD  29.85 
 
 		 167 aa  47  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0581991  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1538  rod shape-determining protein MreD  34.38 
 
 		 163 aa  40.8  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.207887  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2660  rod shape-determining protein MreD  34.25 
 
 		 193 aa  40.8  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.381891 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>