17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3714 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3714  hypothetical protein  100 
 
 
728 aa  1350    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.499099  normal  0.0383844 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37910  hypothetical protein  32.28 
 
 
751 aa  216  1.9999999999999998e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.137873  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3364  hypothetical protein  32.1 
 
 
711 aa  154  7e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31850  hypothetical protein  26.77 
 
 
741 aa  118  3.9999999999999997e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9371  hypothetical protein  26.19 
 
 
713 aa  98.2  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.741382  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4496  hypothetical protein  31.1 
 
 
717 aa  90.1  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.211487  normal  0.179181 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2544  hypothetical protein  27.74 
 
 
820 aa  84  0.000000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.186239  normal  0.111565 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3103  hypothetical protein  28.64 
 
 
835 aa  81.6  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3573  hypothetical protein  25.18 
 
 
814 aa  73.6  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.950608 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5081  glycoprotein  29.21 
 
 
784 aa  69.7  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0297012  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2141  hypothetical protein  29.87 
 
 
820 aa  61.6  0.00000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0602893  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4209  hypothetical protein  31.06 
 
 
703 aa  60.5  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7081  hypothetical protein  25.93 
 
 
764 aa  59.3  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4532  hypothetical protein  24.82 
 
 
884 aa  59.7  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.796948  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4966  hypothetical protein  24.18 
 
 
706 aa  55.5  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7323  hypothetical protein  29.48 
 
 
919 aa  53.5  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.815907 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9037  hypothetical protein  30.12 
 
 
718 aa  49.7  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.671857  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>