17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2345 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2345  hypothetical protein  100 
 
 
507 aa  934    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.274272  hitchhiker  0.00000585461 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09080  hypothetical protein  40.51 
 
 
574 aa  194  3e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.975766  normal  0.391282 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2547  hypothetical protein  36.95 
 
 
538 aa  172  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.278344  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1208  hypothetical protein  36.36 
 
 
528 aa  166  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.560669 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1265  hypothetical protein  41.31 
 
 
558 aa  153  7e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000106204 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1194  hypothetical protein  40.54 
 
 
577 aa  150  5e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20770  hypothetical protein  34.34 
 
 
560 aa  118  3e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0250367  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1859  hypothetical protein  38.93 
 
 
623 aa  114  6e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.163853  normal  0.0142355 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0461  hypothetical protein  33.95 
 
 
513 aa  70.9  0.00000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.274744  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7607  hypothetical protein  35.97 
 
 
582 aa  63.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0753  hypothetical protein  28 
 
 
489 aa  62.4  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0387662 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1384  hypothetical protein  32.53 
 
 
471 aa  58.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0759  hypothetical protein  24.43 
 
 
513 aa  54.3  0.000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.13019  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2513  hypothetical protein  27.52 
 
 
471 aa  49.3  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1413  hypothetical protein  33.33 
 
 
475 aa  47  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0668579  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4066  hypothetical protein  29.06 
 
 
601 aa  45.8  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.356013  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5862  hypothetical protein  29.22 
 
 
525 aa  45.8  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000662704  normal  0.168546 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>