17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1720 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1720  hypothetical protein  100 
 
 
130 aa  261  2e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000883152  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2011  hypothetical protein  38.38 
 
 
124 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.837589  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4717  hypothetical protein  33.66 
 
 
140 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.729727  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3177  hypothetical protein  31.91 
 
 
171 aa  50.4  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.421028  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3698  hypothetical protein  44.23 
 
 
141 aa  48.9  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.309374  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0129  hypothetical protein  32.95 
 
 
139 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0704993  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5433  hypothetical protein  32.31 
 
 
141 aa  46.2  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00625909  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0371  hypothetical protein  47.37 
 
 
145 aa  45.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37992e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1449  hypothetical protein  33.33 
 
 
162 aa  44.7  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1988  hypothetical protein  29.89 
 
 
153 aa  44.3  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1163  hypothetical protein  32.26 
 
 
154 aa  43.9  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567834  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0848  hypothetical protein  28.12 
 
 
136 aa  43.5  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.276759 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6425  hypothetical protein  27.47 
 
 
154 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2222  hypothetical protein  29.89 
 
 
150 aa  42  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14880  hypothetical protein  31.96 
 
 
155 aa  42  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0219247  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3029  hypothetical protein  27.78 
 
 
127 aa  41.2  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1885  hypothetical protein  30.77 
 
 
139 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0572068  normal  0.900072 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>