50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0299 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0299  hypothetical protein  100 
 
 
356 aa  689    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2710  hypothetical protein  51.01 
 
 
369 aa  334  1e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00210144  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4945  hypothetical protein  30.7 
 
 
343 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000030592  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4359  hypothetical protein  30 
 
 
358 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2232  hypothetical protein  32.45 
 
 
349 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1876  hypothetical protein  32.29 
 
 
385 aa  140  4.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3313  hypothetical protein  30.36 
 
 
351 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2221  hypothetical protein  27.71 
 
 
361 aa  125  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2884  hypothetical protein  29.46 
 
 
352 aa  123  5e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23450  hypothetical protein  28.32 
 
 
351 aa  122  8e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000814469  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05130  uncharacterized membrane protein  31.01 
 
 
335 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2565  hypothetical protein  29.86 
 
 
350 aa  120  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2562  hypothetical protein  26.63 
 
 
346 aa  120  4.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0643  hypothetical protein  30.9 
 
 
357 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2507  transporter  29.36 
 
 
341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0517711 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1765  hypothetical protein  27.57 
 
 
346 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2010  hypothetical protein  27.41 
 
 
355 aa  106  8e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.129341  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1518  hypothetical protein  28.36 
 
 
363 aa  104  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.913415  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2248  hypothetical protein  26.22 
 
 
354 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.284315  normal  0.730008 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3490  hypothetical protein  26.22 
 
 
354 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0707746  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0677  hypothetical protein  25.64 
 
 
355 aa  99.8  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.202663  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0692  hypothetical protein  25.64 
 
 
355 aa  99.8  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0235088  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0167  hypothetical protein  25.99 
 
 
361 aa  98.2  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.604308  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1879  hypothetical protein  25.94 
 
 
357 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0308  hypothetical protein  23.17 
 
 
355 aa  95.9  8e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0081  hypothetical protein  25.78 
 
 
367 aa  94  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00405626  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07920  uncharacterized membrane protein  25 
 
 
385 aa  92  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.279282  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1840  hypothetical protein  25.43 
 
 
346 aa  91.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.406982  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2125  hypothetical protein  25.43 
 
 
346 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.586239  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2091  hypothetical protein  25.14 
 
 
346 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.295909  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1870  hypothetical protein  25.71 
 
 
346 aa  90.9  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0416915  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2014  hypothetical protein  24.57 
 
 
346 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.85804  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2046  hypothetical protein  25.71 
 
 
346 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00084703 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1824  hypothetical protein  25.71 
 
 
346 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2012  hypothetical protein  25.71 
 
 
346 aa  90.9  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3295  hypothetical protein  24.57 
 
 
346 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.335957 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1519  hypothetical protein  24.27 
 
 
347 aa  89  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1874  hypothetical protein  23.56 
 
 
346 aa  88.2  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.163445  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2540  hypothetical protein  23.31 
 
 
359 aa  82.4  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2592  hypothetical protein  23.31 
 
 
359 aa  82.4  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0857  hypothetical protein  28.16 
 
 
354 aa  80.1  0.00000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.549671  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12490  uncharacterized membrane protein  23.81 
 
 
459 aa  75.9  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.440212  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0891  hypothetical protein  26.65 
 
 
347 aa  73.2  0.000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0139319  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1661  hypothetical protein  24.92 
 
 
348 aa  72.8  0.000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2079  hypothetical protein  25.69 
 
 
349 aa  72  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21530  uncharacterized membrane protein  22.05 
 
 
408 aa  55.1  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.198401  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0471  hypothetical protein  28.57 
 
 
414 aa  51.2  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0108  hypothetical protein  24.44 
 
 
371 aa  44.3  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0108219  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25260  uncharacterized membrane protein  21.94 
 
 
381 aa  43.9  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.461148  normal  0.040821 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1461  hypothetical protein  23.53 
 
 
378 aa  42.7  0.01  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0143143  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>