16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3152 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3152  hypothetical protein  100 
 
 
466 aa  955    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.416399 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0866  hypothetical protein  31.98 
 
 
406 aa  111  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0582  hypothetical protein  30.53 
 
 
354 aa  98.6  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0582  hypothetical protein  24.05 
 
 
378 aa  94  5e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0242426  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2038  hypothetical protein  33.33 
 
 
351 aa  88.2  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2578  hypothetical protein  35.88 
 
 
280 aa  87.4  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.149067 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4814  hypothetical protein  21.4 
 
 
425 aa  79.7  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2336  hypothetical protein  28.97 
 
 
354 aa  77.4  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0899485  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0075  hypothetical protein  41.56 
 
 
343 aa  73.9  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1312  hypothetical protein  36.94 
 
 
347 aa  72.4  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.667333 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6305  hypothetical protein  36.71 
 
 
331 aa  65.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12173  hypothetical protein  34.78 
 
 
361 aa  64.3  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1943  hypothetical protein  32.58 
 
 
428 aa  64.3  0.000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4660  hypothetical protein  24.44 
 
 
322 aa  62.4  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0511  hypothetical protein  30.11 
 
 
229 aa  61.6  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5328  phage minor structural protein  35 
 
 
2196 aa  43.9  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>