34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0675 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0675  hypothetical protein  100 
 
 
88 aa  169  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0762  hypothetical protein  50.72 
 
 
107 aa  71.6  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.468252 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0621  hypothetical protein  40.28 
 
 
87 aa  58.9  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3332  hypothetical protein  40.28 
 
 
79 aa  57.8  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.296234  normal  0.385711 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1581  hypothetical protein  40.54 
 
 
82 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00359975  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2648  hypothetical protein  38.89 
 
 
80 aa  56.6  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.250231  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0261  hypothetical protein  40.54 
 
 
82 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.783765 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0233  hypothetical protein  40.54 
 
 
82 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1375  protein of unknown function DUF526  44.59 
 
 
96 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.308026  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2263  hypothetical protein  40.85 
 
 
109 aa  55.1  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.904294  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2214  hypothetical protein  38.89 
 
 
84 aa  54.7  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.309689  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3873  hypothetical protein  35.29 
 
 
92 aa  54.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0389052  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1476  hypothetical protein  41.43 
 
 
106 aa  53.9  0.0000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0240368  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1526  hypothetical protein  41.43 
 
 
106 aa  53.9  0.0000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1640  hypothetical protein  40.51 
 
 
106 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0853  hypothetical protein  35.79 
 
 
107 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2149  hypothetical protein  40 
 
 
102 aa  50.8  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2505  hypothetical protein  35.62 
 
 
85 aa  50.8  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.460066 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4841  protein of unknown function DUF526  36.99 
 
 
92 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.546287  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3096  hypothetical protein  40.54 
 
 
85 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1766  hypothetical protein  35.62 
 
 
96 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2547  hypothetical protein  44 
 
 
108 aa  48.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3020  protein of unknown function DUF526  41.56 
 
 
86 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3170  hypothetical protein  40.91 
 
 
91 aa  47.8  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142046  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2757  protein of unknown function DUF526  40 
 
 
86 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1414  hypothetical protein  34.25 
 
 
88 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0680005  normal  0.577769 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4162  hypothetical protein  34.25 
 
 
92 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.186646 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4065  protein of unknown function DUF526  36.11 
 
 
93 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.955686 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3771  hypothetical protein  36.11 
 
 
93 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.208302  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0993  hypothetical protein  33.87 
 
 
88 aa  43.1  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0435364  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3536  hypothetical protein  37.74 
 
 
91 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.764838  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4026  protein of unknown function DUF526  36.11 
 
 
93 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.180444  normal  0.460906 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4470  hypothetical protein  34.72 
 
 
86 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.633615  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2251  hypothetical protein  35.29 
 
 
96 aa  40.4  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.801472  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>