20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0628 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0628  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  321  2e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4554  hypothetical protein  49.21 
 
 
201 aa  126  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0106  hypothetical protein  48.41 
 
 
200 aa  123  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.880809  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1206  PHA synthase subunit PhaR; regulator of PhaP  24.62 
 
 
160 aa  56.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1404  phaR protein  24.62 
 
 
160 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1230  polyhydroxyalkanoic acid synthase, PhaR subunit  24.62 
 
 
160 aa  55.5  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1329  phaR protein  24.62 
 
 
160 aa  55.1  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1229  phaR protein  24.62 
 
 
160 aa  55.1  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.705395  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1208  PHA synthase subunit PhaR; regulator of PhaP  24.62 
 
 
160 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00647485  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1367  phaR protein  23.85 
 
 
160 aa  54.3  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.152883  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3977  phaR protein  23.85 
 
 
160 aa  54.3  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1428  phaR protein  24.62 
 
 
160 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1469  phaR protein  24.62 
 
 
160 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1042  polyhydroxyalkanoic acid synthase, PhaR subunit  22.31 
 
 
160 aa  51.6  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1821  hypothetical protein  27.37 
 
 
112 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.338762  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3644  hypothetical protein  26.32 
 
 
126 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.823648  normal  0.46603 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1243  hypothetical protein  20.57 
 
 
187 aa  44.3  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4292  hypothetical protein  27.47 
 
 
106 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000022825  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2862  hypothetical protein  30.21 
 
 
263 aa  41.2  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0433683  normal  0.10978 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1657  hypothetical protein  28.83 
 
 
125 aa  40.8  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.921397  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>