16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0970 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0970  hypothetical protein  100 
 
 
125 aa  246  5e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.1187  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1239  hypothetical protein  75.63 
 
 
192 aa  186  1e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.86587  normal  0.341042 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1046  hypothetical protein  65.57 
 
 
143 aa  179  9.000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000643846  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1612  hypothetical protein  68.38 
 
 
130 aa  164  5e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00226561  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1674  hypothetical protein  64.23 
 
 
132 aa  157  6e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.664876  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0949  hypothetical protein  57.26 
 
 
136 aa  139  9e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.451912 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1239  hypothetical protein  55.74 
 
 
135 aa  135  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0212836  normal  0.226179 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2340  hypothetical protein  34.48 
 
 
128 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.897475  normal  0.976398 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1677  hypothetical protein  39.05 
 
 
302 aa  59.7  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.366521  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3519  hypothetical protein  39.05 
 
 
302 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1885  hypothetical protein  36.19 
 
 
302 aa  57  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0070787  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1659  hypothetical protein  35.24 
 
 
302 aa  54.7  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.210823  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1934  hypothetical protein  34.29 
 
 
302 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1678  hypothetical protein  34.29 
 
 
167 aa  53.5  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1624  hypothetical protein  34.29 
 
 
302 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0119502  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1858  hypothetical protein  34.29 
 
 
302 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4227900000000003e-34 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>