14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_9037 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_9037  hypothetical protein  100 
 
 
718 aa  1463    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.671857  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9371  hypothetical protein  25.65 
 
 
713 aa  97.4  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.741382  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4966  hypothetical protein  23.16 
 
 
706 aa  89.7  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3573  hypothetical protein  22.89 
 
 
814 aa  75.9  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.950608 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3103  hypothetical protein  24.13 
 
 
835 aa  73.9  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4532  hypothetical protein  25 
 
 
884 aa  60.1  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.796948  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13944  hypothetical protein  24.93 
 
 
802 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00151105  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3714  hypothetical protein  29.69 
 
 
728 aa  49.7  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.499099  normal  0.0383844 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7323  hypothetical protein  23.04 
 
 
919 aa  46.2  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.815907 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39620  hypothetical protein  25.29 
 
 
706 aa  46.2  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.503837 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4225  glycoprotein  25.14 
 
 
831 aa  46.2  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.553317  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37910  hypothetical protein  25.88 
 
 
751 aa  45.8  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.137873  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4850  hypothetical protein  23.02 
 
 
870 aa  45.8  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2141  hypothetical protein  25.68 
 
 
820 aa  44.7  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0602893  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>