14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7283 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7283  rod shape-determining protein MreD  100 
 
 		 193 aa  362  2e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1541  rod shape-determining protein MreD  34.19 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.110151  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0750  rod shape-determining protein MreD  40 
 
 		 171 aa  68.9  0.00000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.276386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7280  hypothetical protein  53.03 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.283498 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2466  rod shape-determining protein MreD  37.1 
 
 		 170 aa  62.8  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.201229 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5267  putative rod shape-determining protein MreD; putative membrane protein  35.25 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.396578 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0851  rod shape-determining protein MreD  42.25 
 
 		 173 aa  55.8  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.161831 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2546  hypothetical protein  26.86 
 
 		 166 aa  51.6  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1213  rod shape-determining protein  33.59 
 
 		 180 aa  51.6  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1351  rod shape-determining protein MreD  35.14 
 
 		 172 aa  48.5  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3463  rod shape-determining protein  39.66 
 
 		 170 aa  43.9  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0895457  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09220  rod shape-determining protein MreD  38 
 
 		 162 aa  43.5  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.635989 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1538  rod shape-determining protein MreD  42.67 
 
 		 163 aa  43.5  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.207887  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0768  rod shape-determining protein MreD  43.33 
 
 		 167 aa  41.6  0.007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0581991  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>