18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5502 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5502  hypothetical protein  100 
 
 
529 aa  1056    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000845668  decreased coverage  0.000369985 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2614  hypothetical protein  60.36 
 
 
509 aa  518  1.0000000000000001e-145  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000491274  normal  0.0136523 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0170  hypothetical protein  42.33 
 
 
517 aa  311  2e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2869  hypothetical protein  29.95 
 
 
545 aa  125  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.265474  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2800  hypothetical protein  29.95 
 
 
545 aa  124  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3863  hypothetical protein  29.88 
 
 
530 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1493  hypothetical protein  27.8 
 
 
505 aa  95.1  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.22386  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3977  hypothetical protein  25.22 
 
 
565 aa  94.7  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21248  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0489  hypothetical protein  24.49 
 
 
540 aa  93.6  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0248447 
 
 
-
 
NC_003296  RS03692  hypothetical protein  27.43 
 
 
517 aa  88.2  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.274894  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1084  hypothetical protein  31.47 
 
 
671 aa  84  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0110678  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0540  hypothetical protein  28.36 
 
 
532 aa  83.6  0.000000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0871  hypothetical protein  26.52 
 
 
492 aa  67.4  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0629  hypothetical protein  25.92 
 
 
513 aa  65.1  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0380  hypothetical protein  25.61 
 
 
540 aa  60.5  0.00000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2248  hypothetical protein  18.5 
 
 
495 aa  57.8  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000920075  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2671  hypothetical protein  34.21 
 
 
235 aa  57  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0247  hypothetical protein  20.86 
 
 
487 aa  51.6  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>