8 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5111 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5111  lipoprotein  100 
 
 		 350 aa  704    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.472196 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2391  lipoprotein  49.69 
 
 		 343 aa  324  1e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142001  normal  0.755106 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4360  hypothetical protein  47.14 
 
 		 352 aa  316  5e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5318  hypothetical protein  46.23 
 
 		 329 aa  248  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0224058  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03172  putative signal peptide protein  34.72 
 
 		 346 aa  143  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.203589 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2685  hypothetical protein  33.91 
 
 		 354 aa  47  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.282963  normal  0.122648 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02335  hypothetical protein  23.32 
 
 		 364 aa  46.2  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.15036  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4172  hypothetical protein  25 
 
 		 349 aa  46.2  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.204573  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>