36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4384 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4384  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  307  4e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.349994 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5390  hypothetical protein  42.96 
 
 
147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1900  hypothetical protein  39.73 
 
 
147 aa  129  9e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0408568  hitchhiker  0.00479184 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2939  hypothetical protein  40.69 
 
 
146 aa  121  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230933  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0931  phage tail protein  38.89 
 
 
150 aa  120  9e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.339945  normal  0.184767 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3817  phage tail protein  32.62 
 
 
146 aa  100  9e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0125737  normal  0.215522 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2261  hypothetical protein  35.92 
 
 
149 aa  98.6  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0999521  hitchhiker  0.00060193 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0976  hypothetical protein  31.62 
 
 
145 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4343  hypothetical protein  29.17 
 
 
141 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0471416  normal  0.110764 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5254  hypothetical protein  29.17 
 
 
147 aa  59.7  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000600416 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2822  phage tail protein  28.23 
 
 
146 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1959  hypothetical protein  25.71 
 
 
147 aa  57.8  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.663764  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1561  phage tail protein  29.9 
 
 
154 aa  57.4  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.187603 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1658  phage tail protein  27.42 
 
 
146 aa  57.4  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664664  normal  0.0320443 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26530  conserved hypothetical phage tail region protein  26.97 
 
 
159 aa  57  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.167509  normal  0.504413 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2190  hypothetical protein  31.85 
 
 
145 aa  55.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.376817  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1058  hypothetical protein  28.29 
 
 
160 aa  52  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0979  hypothetical protein  26.12 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.965809  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2895  hypothetical protein  25.18 
 
 
179 aa  49.7  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1423  hypothetical protein  23.38 
 
 
160 aa  48.5  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3151  phage tail protein  25 
 
 
142 aa  48.5  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0680  hypothetical protein  25 
 
 
156 aa  48.5  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.391136  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2820  phage tail protein  22.39 
 
 
142 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1502  hypothetical protein  22.48 
 
 
147 aa  47.8  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1873  phage tail region protein  21.55 
 
 
146 aa  47.8  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0761  hypothetical protein  25.74 
 
 
150 aa  47.4  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00269614  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1055  hypothetical protein  22.7 
 
 
160 aa  47  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1505  hypothetical protein  23.88 
 
 
157 aa  45.4  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3661  hypothetical protein  21.48 
 
 
149 aa  46.2  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0365523  hitchhiker  0.000649304 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26560  conserved hypothetical phage tail region protein  22.22 
 
 
153 aa  45.4  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00415635  normal  0.705478 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0757  hypothetical protein  18.71 
 
 
150 aa  45.1  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.122144  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0656  hypothetical protein  22.06 
 
 
154 aa  41.6  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0846  hypothetical protein  22.06 
 
 
154 aa  41.2  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3613  phage tail region protein  23.53 
 
 
146 aa  41.2  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000436246 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1039  hypothetical protein  23.88 
 
 
144 aa  40.4  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1660  phage tail protein  22.14 
 
 
142 aa  40.4  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.274017  normal  0.160769 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>