18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4205 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2433  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  44.61 
 
 
916 aa  664    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.618289 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2588  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  44.29 
 
 
919 aa  654    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.233589  normal  0.182306 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4205  Lantibiotic dehydratase domain protein  100 
 
 
937 aa  1870    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.254357  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3692  Lantibiotic dehydratase domain protein  43.34 
 
 
904 aa  651    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0922  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  23.84 
 
 
895 aa  152  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4231  Lantibiotic dehydratase domain protein  22.27 
 
 
962 aa  131  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5328  Lantibiotic dehydratase domain protein  29.61 
 
 
851 aa  97.4  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.476172 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1490  Lantibiotic dehydratase domain protein  26.58 
 
 
897 aa  95.9  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.190845 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3861  Lantibiotic dehydratase domain protein  25.83 
 
 
817 aa  90.1  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.348324  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0550  Lantibiotic dehydratase domain-containing protein  32.2 
 
 
858 aa  84.7  0.000000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13765  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4196  hypothetical protein  24.32 
 
 
853 aa  71.6  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0066  Lantibiotic dehydratase domain protein  26.38 
 
 
1148 aa  55.8  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.433774 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3048  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  27.59 
 
 
749 aa  50.1  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.202481 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1127  lantibiotic dehydratase-like  28.76 
 
 
1029 aa  48.1  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4704  Lantibiotic dehydratase domain protein  22.58 
 
 
1060 aa  47.8  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0103  hypothetical protein  31.4 
 
 
862 aa  47.8  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.663755  normal  0.988886 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0556  Lantibiotic dehydratase domain protein  22.15 
 
 
757 aa  45.4  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.111003 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2426  hypothetical protein  32.43 
 
 
761 aa  44.7  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0137052  normal  0.06951 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>