11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3986 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3986  hypothetical protein  100 
 
 		 498 aa  1004    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0130499  normal  0.343534 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6800  hypothetical protein  57.02 
 
 		 484 aa  488  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.73776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4771  hypothetical protein  42.95 
 
 		 459 aa  321  1.9999999999999998e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.186259 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1447  hypothetical protein  35.79 
 
 		 535 aa  196  9e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.124723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1296  hypothetical protein  34.14 
 
 		 528 aa  189  1e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01569  hypothetical protein  31.71 
 
 		 530 aa  170  6e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2539  hypothetical protein  25.05 
 
 		 405 aa  67  0.0000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4637  hypothetical protein  23.37 
 
 		 343 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2690  hypothetical protein  25.17 
 
 		 343 aa  60.8  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192027  normal  0.887483 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3583  hypothetical protein  24.58 
 
 		 408 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.601802  normal  0.424709 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1171  hypothetical protein  22.46 
 
 		 299 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.286882  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>