22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3937 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3937  Lanthionine synthetase C family protein  100 
 
 		 367 aa  719    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.207083  normal  0.0864973 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1126  lanthionine synthetase C-like  43.85 
 
 		 405 aa  240  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3314  hypothetical protein  43.75 
 
 		 381 aa  234  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.111602 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6754  lanthionine synthetase C family protein  44.41 
 
 		 358 aa  216  4e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49413 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1333  lanthionine synthetase C family protein  42.49 
 
 		 436 aa  214  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.551355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0603  lanthionine synthetase C family protein  42.08 
 
 		 420 aa  213  5.999999999999999e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1822  hypothetical protein  45.55 
 
 		 408 aa  212  7e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.961315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2800  lanthionine synthetase C family protein  41.29 
 
 		 399 aa  202  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4648  Lanthionine synthetase C family protein  43.92 
 
 		 390 aa  191  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2032  hypothetical protein  45.87 
 
 		 412 aa  190  4e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.570232 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0055  lanthionine synthetase C family protein  43.54 
 
 		 395 aa  178  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0205  hypothetical protein  41.75 
 
 		 412 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0827399 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5418  Lanthionine synthetase C family protein  38.16 
 
 		 409 aa  109  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3603  Lanthionine synthetase C family protein  32.61 
 
 		 409 aa  100  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.853914 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3997  hypothetical protein  40.88 
 
 		 242 aa  91.7  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.366143  normal  0.539174 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3531  hypothetical protein  40.74 
 
 		 427 aa  73.6  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0966276  normal  0.218294 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4144  Lanthionine synthetase C family protein  27.65 
 
 		 491 aa  59.3  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.732259  normal  0.0439523 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3397  Lanthionine synthetase C family protein  24.17 
 
 		 391 aa  55.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.829855  normal  0.741439 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1439  Lanthionine synthetase C family protein  28.79 
 
 		 404 aa  51.2  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3102  Lanthionine synthetase C family protein  28.09 
 
 		 466 aa  51.2  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.220551 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4705  Lanthionine synthetase C family protein  24.52 
 
 		 414 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4693  Lanthionine synthetase C family protein  29.81 
 
 		 385 aa  45.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205081  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>