13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1956 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1956  putative alanine-rich protein  100 
 
 		 378 aa  756    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5155  putative alanine-rich protein  65.32 
 
 		 372 aa  466  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.215555  normal  0.0173621 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0478  hypothetical protein  37.79 
 
 		 408 aa  188  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1082  hypothetical protein  38.78 
 
 		 384 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0109535  hitchhiker  0.00376234 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1489  hypothetical protein  35.14 
 
 		 377 aa  179  7e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2098  conserved hypothetical alanine-rich protein  34.88 
 
 		 395 aa  177  3e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000748992 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0753  hypothetical protein  34.87 
 
 		 379 aa  169  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0998  hypothetical protein  26.25 
 
 		 393 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6376  hypothetical protein  30.56 
 
 		 394 aa  93.6  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12547  normal  0.702736 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0476  hypothetical protein  26.59 
 
 		 412 aa  86.7  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.296248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4246  hypothetical protein  25.64 
 
 		 411 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000111779  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1555  hypothetical protein  32 
 
 		 403 aa  79.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5105  hypothetical protein  28.71 
 
 		 405 aa  53.5  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.967556  normal  0.359869 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>