17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4814 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_4814  hypothetical protein  100 
 
 
425 aa  867    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0866  hypothetical protein  28.43 
 
 
406 aa  135  9.999999999999999e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0582  hypothetical protein  24.31 
 
 
354 aa  118  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12173  hypothetical protein  24.62 
 
 
361 aa  93.6  6e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1312  hypothetical protein  22.85 
 
 
347 aa  86.7  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.667333 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2038  hypothetical protein  25.6 
 
 
351 aa  82.4  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4660  hypothetical protein  28.67 
 
 
322 aa  80.9  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3152  hypothetical protein  36.67 
 
 
466 aa  75.9  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.416399 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0511  hypothetical protein  42.39 
 
 
229 aa  72.8  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2578  hypothetical protein  26.42 
 
 
280 aa  69.7  0.00000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.149067 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6305  hypothetical protein  37.21 
 
 
331 aa  68.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0582  hypothetical protein  20.27 
 
 
378 aa  66.6  0.0000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0242426  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04041  hypothetical protein  26.09 
 
 
281 aa  65.1  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2336  hypothetical protein  24.07 
 
 
354 aa  63.2  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0899485  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_002950  PG1943  hypothetical protein  28.74 
 
 
428 aa  59.7  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0075  hypothetical protein  38.16 
 
 
343 aa  57.8  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2453  hypothetical protein  32.18 
 
 
233 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.438658  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>