14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3619 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_3619  hypothetical protein  100 
 
 
160 aa  328  1e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.119936  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2017  hypothetical protein  27.54 
 
 
146 aa  50.8  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1040  hypothetical protein  27.54 
 
 
146 aa  50.8  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.103705  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1327  hypothetical protein  27.54 
 
 
146 aa  50.8  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3198  hypothetical protein  27.54 
 
 
146 aa  50.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.243896  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3071  hypothetical protein  27.54 
 
 
146 aa  50.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.368964  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2306  hypothetical protein  26.81 
 
 
190 aa  50.8  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1412  hypothetical protein  27.54 
 
 
190 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03347  putative orphan protein  29.11 
 
 
76 aa  49.3  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5132  hypothetical protein  29.31 
 
 
144 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5221  hypothetical protein  29.31 
 
 
144 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.830501 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2152  hypothetical protein  28.57 
 
 
142 aa  48.5  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5513  hypothetical protein  29.31 
 
 
144 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.641522 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03348  hypothetical protein  34 
 
 
79 aa  42.4  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>