18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3407 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3407  putative lipoprotein  100 
 
 		 157 aa  313  5e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.466049  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4061  putative lipoprotein  55.41 
 
 		 155 aa  178  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1062  putative lipoprotein  64.66 
 
 		 150 aa  165  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341373 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3295  putative lipoprotein  64.66 
 
 		 150 aa  165  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3516  putative lipoprotein  64.66 
 
 		 150 aa  165  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.699478 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0968  putative lipoprotein  56.05 
 
 		 152 aa  164  5e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0972  putative lipoprotein  62.18 
 
 		 150 aa  164  5e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1010  putative lipoprotein  62.18 
 
 		 150 aa  164  5e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.644367 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0976  putative lipoprotein  62.18 
 
 		 150 aa  164  5e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3391  putative lipoprotein  66.07 
 
 		 150 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0905  putative lipoprotein  60.16 
 
 		 152 aa  148  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2209  hypothetical protein  41.3 
 
 		 83 aa  62  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2181  hypothetical protein  41.3 
 
 		 83 aa  62  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3695  hypothetical protein  55.36 
 
 		 94 aa  60.8  0.000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0221035 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4399  hypothetical protein  54.9 
 
 		 91 aa  60.8  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.95537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2221  hypothetical protein  53.06 
 
 		 86 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.700232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2832  hypothetical protein  58.33 
 
 		 85 aa  56.2  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3399  hypothetical protein  40 
 
 		 87 aa  43.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0815274  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>