145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3129 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_3129  acetyltransferase  100 
 
 
140 aa  297  3e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05633  hypothetical protein  55.3 
 
 
136 aa  168  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1013  GCN5-related N-acetyltransferase  42.54 
 
 
135 aa  126  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.985217 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5274  GCN5-related N-acetyltransferase  41.79 
 
 
137 aa  120  7e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4865  GCN5-related N-acetyltransferase  35.56 
 
 
135 aa  105  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.226634  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0509  GCN5-related N-acetyltransferase  39.1 
 
 
138 aa  103  9e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12541  hypothetical protein  36.15 
 
 
141 aa  99.4  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0637  GCN5-related N-acetyltransferase  34.33 
 
 
139 aa  94.4  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1368  GCN5-related N-acetyltransferase  36.72 
 
 
146 aa  92  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1830  phosphoribosylformimino-5-aminoimidazole carboxamide ribotide isomerase  35.29 
 
 
389 aa  80.5  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2770  GCN5-related N-acetyltransferase  28.36 
 
 
136 aa  79.3  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3336  GCN5-related N-acetyltransferase  32.62 
 
 
143 aa  79  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0612  GCN5-related N-acetyltransferase  32.28 
 
 
145 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.246567  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0825  acetyltransferase, GNAT family  30.14 
 
 
145 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0482987  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4606  acetyltransferase, GNAT family  30.82 
 
 
145 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.275235  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09653  Acetyltransferase  33.83 
 
 
146 aa  64.7  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.589876  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0766  acetyltransferase  29.45 
 
 
145 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0752  acetyltransferase, GNAT family  28.47 
 
 
145 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000179792 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0731  acetyltransferase, GNAT family  30.14 
 
 
145 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.826368  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0607  acetyltransferase  27.78 
 
 
145 aa  62.8  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0608  acetyltransferase  27.78 
 
 
145 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0585  GCN5-related N-acetyltransferase  29.58 
 
 
145 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000896177  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0093  GCN5-related N-acetyltransferase  29.69 
 
 
151 aa  61.2  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0017164  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0663  acetyltransferase  27.78 
 
 
145 aa  60.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0697  acetyltransferase  27.78 
 
 
145 aa  60.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7249  GCN5-related N-acetyltransferase  31.62 
 
 
154 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0771  GCN5-related N-acetyltransferase  29.59 
 
 
143 aa  53.9  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0804  GCN5-related N-acetyltransferase  29.46 
 
 
141 aa  51.6  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.863127  normal  0.0451804 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1915  putative acetyltransferase  29.17 
 
 
141 aa  52  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.493775  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C08  acetyltransferase  31.03 
 
 
165 aa  51.2  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2448  GCN5-related N-acetyltransferase  34.43 
 
 
140 aa  50.4  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6154  GCN5-related N-acetyltransferase  27.91 
 
 
146 aa  50.4  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.229452  normal  0.103158 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1919  GCN5-related N-acetyltransferase  27.55 
 
 
150 aa  50.4  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540179  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1972  GCN5-related N-acetyltransferase  35.37 
 
 
286 aa  50.1  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1673  acyltransferase-like  24.65 
 
 
320 aa  49.7  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5580  GCN5-related N-acetyltransferase  30.25 
 
 
154 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2986  acetyltransferase, GNAT family  25.74 
 
 
145 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0143175  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5944  GCN5-related N-acetyltransferase  30.25 
 
 
154 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.423747 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2599  GCN5-related N-acetyltransferase  25.74 
 
 
150 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1461  acetyltransferase  22.92 
 
 
156 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1847  acetyltransferase  22.92 
 
 
156 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0423  acetyltransferase  22.92 
 
 
156 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0834  acetyltransferase  22.92 
 
 
156 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2936  putative acyltransferase  30.69 
 
 
299 aa  48.5  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04248  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  30.59 
 
 
148 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.258576  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3626  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.59 
 
 
148 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0500841  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2150  acetyltransferase  23.88 
 
 
139 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0520  acetyltransferase  22.92 
 
 
156 aa  47.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5885  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  30.59 
 
 
148 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.276325  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4607  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  30.59 
 
 
148 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000779076  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4968  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  30.59 
 
 
148 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00012833  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3684  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  30.59 
 
 
148 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.895597  hitchhiker  0.000147746 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4920  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  30.59 
 
 
148 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0578007  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04214  hypothetical protein  30.59 
 
 
148 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.31912  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0491  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  27.05 
 
 
148 aa  47.8  0.00005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1377  GCN5-related N-acetyltransferase  31.94 
 
 
146 aa  47.8  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0611  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  34.18 
 
 
147 aa  47.8  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2101  acetyltransferase  24.83 
 
 
161 aa  47.4  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.472438  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1339  GCN5-related N-acetyltransferase  24.11 
 
 
146 aa  47.4  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2106  hypothetical protein  25 
 
 
252 aa  47  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1947  GCN5-related N-acetyltransferase  26.85 
 
 
159 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.136554  normal  0.715012 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6703  GCN5-related N-acetyltransferase  28.21 
 
 
154 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.402306 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0828  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  34.18 
 
 
147 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141904  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2386  GCN5-related N-acetyltransferase  22.43 
 
 
144 aa  46.2  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.268987  normal  0.639753 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0688  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 
149 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6143  GCN5-related N-acetyltransferase  35.19 
 
 
115 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.420061 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6446  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 
154 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0716  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 
149 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.795595  normal  0.113165 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3493  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.21 
 
 
153 aa  45.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000220651 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0610  GCN5-related N-acetyltransferase  25.61 
 
 
85 aa  45.1  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6182  GCN5-related N-acetyltransferase  31.4 
 
 
148 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1347  acetyltransferase  31.4 
 
 
148 aa  44.7  0.0004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1897  GCN5-related N-acetyltransferase  31.4 
 
 
148 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3505  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  27.27 
 
 
147 aa  45.1  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0838  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  38.46 
 
 
103 aa  44.7  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3634  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  27.27 
 
 
147 aa  45.1  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3422  GCN5-related N-acetyltransferase  26.17 
 
 
144 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1920  GCN5-related N-acetyltransferase  31.4 
 
 
148 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.391479 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0718  GCN5-related N-acetyltransferase  22.31 
 
 
149 aa  44.7  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001898  galactoside O-acetyltransferase  28.74 
 
 
305 aa  44.7  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4018  acetyltransferase  26.17 
 
 
142 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565073  normal  0.275059 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1815  GCN5-related N-acetyltransferase  26.17 
 
 
142 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.135048  normal  0.188952 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2095  hypothetical protein  22.62 
 
 
257 aa  44.3  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2799  GCN5-related N-acetyltransferase  26.5 
 
 
154 aa  44.3  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4916  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  28.24 
 
 
148 aa  43.9  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000006262  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0932  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
176 aa  44.3  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.543398  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1190  GCN5-related N-acetyltransferase  29.73 
 
 
159 aa  43.9  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.595635 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2022  GCN5-related N-acetyltransferase  23.23 
 
 
144 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0535871  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5197  GCN5-related N-acetyltransferase  30.56 
 
 
146 aa  43.9  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2555  acetyltransferase  21.43 
 
 
144 aa  42.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0530574  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0532  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  24.55 
 
 
147 aa  43.5  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.237603  normal  0.0207695 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2799  acetyltransferase, GNAT family  21.43 
 
 
144 aa  42.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000134155 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2312  hypothetical protein  28.24 
 
 
310 aa  43.5  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0217  aminotransferase class I and II  27.45 
 
 
521 aa  43.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00595  acetyltransferase  29.41 
 
 
300 aa  43.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3913  GCN5-related N-acetyltransferase  27.38 
 
 
142 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0440  GCN5-related N-acetyltransferase  26.76 
 
 
168 aa  42.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.293848  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1330  GCN5-related N-acetyltransferase  30.69 
 
 
146 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0879736  normal  0.150143 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4113  acetyltransferase  27.06 
 
 
313 aa  42.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.464087  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4411  thioesterase/acetyltransferase domain-containing protein  27.85 
 
 
313 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>