21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2492 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2492  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  382  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.122738  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3701  hypothetical protein  31.85 
 
 		 185 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0530  protein of unknown function DUF922  28.4 
 
 		 209 aa  80.9  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0183293  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0542  protein of unknown function DUF922  26.95 
 
 		 209 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1535  hypothetical protein  22.82 
 
 		 226 aa  67  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2184  protein of unknown function DUF922  22.73 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.426082  normal  0.0144994 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1972  protein of unknown function DUF922  22.08 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.416237 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2245  hypothetical protein  20.67 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.313687  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1411  hypothetical protein  21.09 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0206  secreted Zn-dependent protease-like protein  23.23 
 
 		 184 aa  52.8  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.376649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2114  hypothetical protein  18.39 
 
 		 206 aa  51.6  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2684  protein of unknown function DUF922  24.39 
 
 		 198 aa  51.6  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0966382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0920  hypothetical protein  23.93 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.901036  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4432  hypothetical protein  23.53 
 
 		 199 aa  49.7  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.266616  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0011  hypothetical protein  21.26 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0009  hypothetical protein  20.69 
 
 		 202 aa  48.5  0.00006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0994  hypothetical protein  18.92 
 
 		 197 aa  48.1  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1028  hypothetical protein  18.92 
 
 		 206 aa  48.1  0.00008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0750897  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2942  protein of unknown function DUF922  24.09 
 
 		 223 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.164247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5905  hypothetical protein  24.78 
 
 		 216 aa  45.4  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4366  hypothetical protein  19.13 
 
 		 192 aa  43.9  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>