71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2304 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2304  putative type IV pilus biogenesis protein pilZ  100 
 
 		 108 aa  223  7e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2501  type IV pilus assembly PilZ  44.86 
 
 		 121 aa  93.2  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.313407  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02715  type IV fimbriae assembly protein  44.86 
 
 		 114 aa  92.8  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.450475  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0879  type IV pilus assembly PilZ  43.93 
 
 		 117 aa  91.7  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.766013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2041  type IV pilus biogenesis protein pilZ  40.74 
 
 		 108 aa  89  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.307465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1573  type IV pilus assembly PilZ  45.26 
 
 		 116 aa  87.4  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1738  type IV pilus biogenesis protein pilZ  38.89 
 
 		 108 aa  87.4  6e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.254841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2049  type IV pilus assembly PilZ  39.81 
 
 		 108 aa  87.4  6e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1768  type IV pilus biogenesis protein pilZ  38.89 
 
 		 108 aa  86.3  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.598238  normal  0.61176 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1663  type IV pilus biogenesis protein pilZ  38.89 
 
 		 108 aa  86.3  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2238  type IV pilus biogenesis protein pilZ  37.04 
 
 		 108 aa  85.5  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2611  type IV pilus biogenesis protein pilZ  37.96 
 
 		 108 aa  85.5  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2646  type IV pilus assembly PilZ  36.11 
 
 		 108 aa  85.1  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.109453 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1356  hypothetical protein  38.68 
 
 		 118 aa  84.3  5e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1352  hypothetical protein  38.68 
 
 		 118 aa  84.3  5e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1719  type IV pilus assembly PilZ  43.3 
 
 		 119 aa  84.3  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.137522 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1985  type IV pilus assembly PilZ  43.3 
 
 		 119 aa  84.3  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1582  type IV fimbriae assembly protein  42.06 
 
 		 117 aa  84  7e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0574097  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1639  type IV fimbriae assembly protein  42.06 
 
 		 117 aa  84  7e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1925  type IV pilus biogenesis protein PilZ  36.11 
 
 		 108 aa  83.6  8e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1581  type IV pilus assembly PilZ  37.04 
 
 		 108 aa  83.6  9e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.875524  normal  0.520302 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2212  type IV pilus biogenesis protein PilZ  37.04 
 
 		 108 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1984  type IV pilus assembly PilZ  36.11 
 
 		 108 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.748677  normal  0.0111146 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1635  type IV pilus assembly PilZ  43.16 
 
 		 118 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2570  type IV pilus biogenesis protein PilZ  37.04 
 
 		 108 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.207839  normal  0.0806474 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2450  type IV pilus biogenesis protein PilZ  37.04 
 
 		 108 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0971788  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1894  type IV pilus biogenesis protein PilZ  37.04 
 
 		 108 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0727827 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4150  Type IV pilus assembly PilZ  43.16 
 
 		 118 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.440208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2457  type IV pilus biogenesis protein PilZ  37.04 
 
 		 108 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0645818  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2195  Type IV pilus assembly PilZ  39.25 
 
 		 120 aa  81.3  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.609234 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1414  type IV pilus assembly PilZ  40.57 
 
 		 120 aa  81.3  0.000000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.152869  normal  0.660499 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3410  type IV pilus assembly PilZ  41.24 
 
 		 119 aa  80.1  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.595597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2201  type 4 fimbrial biogenesis protein PilZ  41.05 
 
 		 118 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.466832  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25770  type 4 fimbrial biogenesis protein PilZ  41.05 
 
 		 118 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.961132  normal  0.553234 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14990  type IV pilus assembly protein  40.74 
 
 		 118 aa  80.1  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2257  type IV pilus assembly PilZ  41.24 
 
 		 120 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1880  type IV pilus assembly PilZ  39.81 
 
 		 126 aa  79  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0639562 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2517  type IV pilus assembly PilZ  38.14 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.179103  hitchhiker  0.00950119 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1654  Type IV pilus assembly PilZ  42.11 
 
 		 118 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0394922  normal  0.307598 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3825  type IV pilus biogenesis protein PilZ  42.11 
 
 		 118 aa  77.4  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0373515  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1653  type 4 fimbrial biogenesis protein PilZ  41.05 
 
 		 117 aa  77.8  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1827  type IV pilus assembly PilZ  36.79 
 
 		 113 aa  76.6  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1786  putative type 4 fimbrial biogenesis protein  38.32 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0774026  normal  0.113647 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1858  type IV pilus assembly protein  38.46 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.595679 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3390  type IV pilus assembly PilZ  39.18 
 
 		 119 aa  74.7  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0381125 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1423  type IV pilus assembly PilZ  37.38 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.208847 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1608  type IV pilus assembly PilZ  39.13 
 
 		 109 aa  74.7  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0391991  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1464  type IV pilus assembly PilZ  37.38 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0634618  normal  0.0114903 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1950  type IV pilus assembly PilZ  34.69 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.700098 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2856  type IV pilus assembly PilZ  40.82 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1007  type IV pilus assembly PilZ  38.14 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1658  Type IV pilus assembly PilZ  39.58 
 
 		 123 aa  73.2  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0211682  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1436  Type IV pilus assembly PilZ  38.32 
 
 		 135 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1826  type IV pilus assembly PilZ  37.38 
 
 		 136 aa  71.6  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0973096  normal  0.0117521 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1994  type 4 fimbrial biogenesis protein PilZ  39.58 
 
 		 118 aa  71.6  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1541  type IV pilus assembly protein PilZ  32.71 
 
 		 123 aa  71.2  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0811165  normal  0.123076 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1144  type IV pilus assembly PilZ  37 
 
 		 113 aa  68.2  0.00000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.136177  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1498  type IV pilus assembly PilZ  33.64 
 
 		 123 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.133421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1066  type IV pilus assembly PilZ  30.93 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0651699  normal  0.921742 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1590  type IV pilus assembly PilZ  36.71 
 
 		 118 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0382259 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1915  type IV pilus assembly protein PilZ, putative  36.71 
 
 		 118 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1251  type IV pilus assembly PilZ  38.54 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1312  type IV fimbriae assembly protein  27.84 
 
 		 115 aa  52.8  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.826043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2361  hypothetical protein  30.26 
 
 		 118 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1598  type IV pilus assembly PilZ  30.26 
 
 		 118 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1503  type IV pilus assembly PilZ  30.26 
 
 		 118 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3886  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  30.49 
 
 		 279 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.267339  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3745  response regulator receiver domain-containing protein  28.09 
 
 		 280 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3802  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  30.49 
 
 		 279 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0707641  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6446  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  28.72 
 
 		 265 aa  40.8  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4589  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  27.17 
 
 		 239 aa  40  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.527063  normal  0.284097 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>