79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2123 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2123  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  347  5e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01852  flagellar biosynthesis protein FlhF  63.25 
 
 		 174 aa  227  7e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0737  membrane protein  55.03 
 
 		 174 aa  218  3.9999999999999997e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1471  hypothetical protein  57.23 
 
 		 176 aa  217  7e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1666  hypothetical protein  58.58 
 
 		 169 aa  214  4e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.257609  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1703  hypothetical protein  58.58 
 
 		 169 aa  214  4e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2676  hypothetical protein  58.58 
 
 		 169 aa  214  4e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1555  hypothetical protein  58.58 
 
 		 169 aa  214  5e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1681  hypothetical protein  57.99 
 
 		 169 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2586  hypothetical protein  57.4 
 
 		 169 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.757893  normal  0.0816334 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1817  hypothetical protein  57.83 
 
 		 168 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0392533  normal  0.0810323 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2201  hypothetical protein  57.23 
 
 		 167 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003989  hypothetical protein  55.03 
 
 		 169 aa  211  3.9999999999999995e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1636  hypothetical protein  58.43 
 
 		 168 aa  210  5.999999999999999e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.687372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1778  hypothetical protein  58.58 
 
 		 180 aa  210  7.999999999999999e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.728961  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01533  hypothetical protein  53.85 
 
 		 169 aa  209  1e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2424  hypothetical protein  56.21 
 
 		 169 aa  209  2e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.433268  normal  0.183637 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2494  hypothetical protein  56.21 
 
 		 169 aa  209  2e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.101154 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2804  hypothetical protein  56.21 
 
 		 169 aa  209  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1335  hypothetical protein  57.99 
 
 		 169 aa  206  1e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.72512 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2390  hypothetical protein  57.23 
 
 		 169 aa  206  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.194438  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1768  hypothetical protein  56.63 
 
 		 168 aa  204  5e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.254976  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2828  hypothetical protein  57.32 
 
 		 159 aa  194  6e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0499107 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1507  hypothetical protein  47.93 
 
 		 208 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0898  hypothetical protein  50 
 
 		 169 aa  179  1e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.749286 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3818  hypothetical protein  50.96 
 
 		 210 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2176  hypothetical protein  45.73 
 
 		 177 aa  176  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14720  hypothetical protein  47.93 
 
 		 175 aa  176  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00102497  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25470  hypothetical protein  46.34 
 
 		 177 aa  176  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4179  hypothetical protein  45.18 
 
 		 172 aa  175  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764127 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1472  hypothetical protein  47.34 
 
 		 212 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1367  hypothetical protein  46.43 
 
 		 174 aa  164  5e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1610  hypothetical protein  43.2 
 
 		 175 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.147771 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0956  hypothetical protein  47.9 
 
 		 179 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2148  hypothetical protein  48.52 
 
 		 171 aa  157  8e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.446802 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1584  hypothetical protein  42.68 
 
 		 185 aa  150  7e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.452951  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2626  hypothetical protein  47.06 
 
 		 198 aa  150  7e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1745  hypothetical protein  49.66 
 
 		 163 aa  150  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1701  hypothetical protein  45.56 
 
 		 177 aa  148  4e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0167634 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1201  Protein of unknown function DUF2062  42.24 
 
 		 188 aa  144  6e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0952689 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1438  hypothetical protein  38.46 
 
 		 196 aa  129  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.244282  normal  0.395476 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1250  hypothetical protein  41.29 
 
 		 186 aa  123  1e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0790  hypothetical protein  35 
 
 		 197 aa  120  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0872806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0784  hypothetical protein  33.89 
 
 		 197 aa  115  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.11051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0658  Protein of unknown function DUF2062  36.59 
 
 		 179 aa  110  7.000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1989  hypothetical protein  37.42 
 
 		 178 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2671  hypothetical protein  42.11 
 
 		 178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2833  hypothetical protein  35.8 
 
 		 182 aa  100  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0982426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2507  hypothetical protein  34.86 
 
 		 198 aa  99.8  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.792495  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0394  hypothetical protein  31.52 
 
 		 180 aa  96.3  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0609  hypothetical protein  31.41 
 
 		 163 aa  95.5  3e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0557  hypothetical protein  39.74 
 
 		 171 aa  88.6  4e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.235942  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1643  Protein of unknown function DUF2062  32.33 
 
 		 163 aa  86.3  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0318  hypothetical protein  30.46 
 
 		 176 aa  81.6  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.706002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1383  hypothetical protein  28.66 
 
 		 180 aa  79.3  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1214  hypothetical protein  28.05 
 
 		 188 aa  78.2  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1729  hypothetical protein  28.32 
 
 		 221 aa  77.8  0.00000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.817068 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0515  hypothetical protein  27.27 
 
 		 191 aa  67.4  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838084  normal  0.7935 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2163  putative membrane protein with signal peptide  30.93 
 
 		 181 aa  63.5  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000423148  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3294  hypothetical protein  31.03 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.943309  normal  0.515332 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2731  hypothetical protein  29.37 
 
 		 176 aa  50.1  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3586  hypothetical protein  26.02 
 
 		 165 aa  50.1  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000285245  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1445  hypothetical protein  25.99 
 
 		 186 aa  48.5  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4776  hypothetical protein  26.09 
 
 		 187 aa  47.4  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2630  hypothetical protein  28.37 
 
 		 191 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.662517  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3779  hypothetical protein  26.36 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0482  hypothetical protein  28.93 
 
 		 186 aa  46.6  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.322183  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0658  hypothetical protein  28.23 
 
 		 190 aa  46.6  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.381208  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0643  hypothetical protein  28.93 
 
 		 186 aa  46.6  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0651  hypothetical protein  28.23 
 
 		 190 aa  46.6  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.849018  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4460  hypothetical protein  24.68 
 
 		 192 aa  46.6  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10012 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1849  hypothetical protein  34.92 
 
 		 165 aa  45.1  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1399  hypothetical protein  33.33 
 
 		 218 aa  45.1  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1362  hypothetical protein  31.33 
 
 		 171 aa  44.7  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3130  hypothetical protein  28.44 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0121568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2575  hypothetical protein  30.43 
 
 		 218 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0291416 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0502  hypothetical protein  30.94 
 
 		 210 aa  42.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000282211 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27551  hypothetical protein  30.99 
 
 		 167 aa  41.6  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2062  hypothetical protein  25 
 
 		 173 aa  40.8  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.687582  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>