48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1814 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1814  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  388  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.660387  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0305  hypothetical protein  53.89 
 
 		 193 aa  218  6e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1973  hypothetical protein  40.47 
 
 		 232 aa  159  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5028  putative lipoprotein  37.97 
 
 		 172 aa  129  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6211  hypothetical protein  37.58 
 
 		 182 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0505  putative lipoprotein  35.8 
 
 		 212 aa  124  6e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0127462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0540  hypothetical protein  35.8 
 
 		 177 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4472  putative lipoprotein  36.72 
 
 		 174 aa  123  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71580  hypothetical protein  35.37 
 
 		 182 aa  123  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0558  lipoprotein  36.42 
 
 		 171 aa  121  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.950452  normal  0.717571 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3430  hypothetical protein  40 
 
 		 171 aa  121  8e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0680  lipoprotein, putative  38.51 
 
 		 174 aa  119  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0550  lipoprotein  35.4 
 
 		 190 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.916886 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3866  hypothetical protein  35.44 
 
 		 173 aa  118  6e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0141  hypothetical protein  34.32 
 
 		 177 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06620  hypothetical protein  37.04 
 
 		 171 aa  115  5e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.600146  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5045  hypothetical protein  37.04 
 
 		 180 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.110017 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5491  hypothetical protein  34.76 
 
 		 182 aa  112  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1036  hypothetical protein  44.12 
 
 		 172 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11280  hypothetical protein  43.43 
 
 		 172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01230  hypothetical protein  32.6 
 
 		 195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0115  hypothetical protein  34.91 
 
 		 178 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5619  hypothetical protein  32.52 
 
 		 197 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.774523  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5333  hypothetical protein  34.09 
 
 		 189 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00441093 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5241  hypothetical protein  34.09 
 
 		 177 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.98466  normal  0.106495 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3492  hypothetical protein  34.76 
 
 		 214 aa  104  6e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0303  hypothetical protein  37.5 
 
 		 219 aa  104  7e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.965134  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0142  hypothetical protein  34.52 
 
 		 153 aa  104  7e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.143516  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001702  hypothetical protein  32.8 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00771  hypothetical protein  32.2 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5382  hypothetical protein  34.36 
 
 		 177 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.246443 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0425  hypothetical protein  36.3 
 
 		 161 aa  102  5e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00217  lipoprotein, putative  48.89 
 
 		 158 aa  101  7e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2156  hypothetical protein  32.32 
 
 		 183 aa  100  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.811392 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3393  hypothetical protein  33.76 
 
 		 184 aa  99.4  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.191739  normal  0.131227 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2133  hypothetical protein  31.09 
 
 		 173 aa  98.2  6e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1829  hypothetical protein  33.91 
 
 		 203 aa  93.2  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1562  hypothetical protein  32.69 
 
 		 213 aa  90.1  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410423  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3556  hypothetical protein  31.87 
 
 		 190 aa  87.4  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.171808 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2155  hypothetical protein  38.54 
 
 		 206 aa  84.3  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2285  hypothetical protein  44.58 
 
 		 218 aa  79.3  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05705  hypothetical protein  37.11 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1843  hypothetical protein  30.38 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0703  hypothetical protein  46.58 
 
 		 204 aa  71.6  0.000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00895458  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3621  hypothetical protein  37.5 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4181  hypothetical protein  32.98 
 
 		 155 aa  67  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.526119 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3013  hypothetical protein  30.51 
 
 		 239 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.195597  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4728  hypothetical protein  40.3 
 
 		 185 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>