23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1471 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1471  putative flagellar protein FlgN  100 
 
 		 148 aa  288  1e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1335  FlgN family protein  36.09 
 
 		 141 aa  72  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.301574  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3105  FlgN  30.37 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.761688  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02935  putative flagellar protein FlgN  29.1 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.493772  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3105  FlgN family protein  32.28 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1411  FlgN family protein  31.5 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2952  FlgN family protein  31.5 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.409825  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2602  FlgN family protein  31.06 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.813191  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2967  FlgN family protein  31.5 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.361827  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1340  FlgN family protein  33.33 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1156  FlgN family protein  29.55 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2343  polar flagellar FlgN, putative chaperone  26.09 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.312185  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1316  FlgN family protein  28.79 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.297845 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1254  FlgN family protein  28.79 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1324  FlgN family protein  28.79 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1592  FlgN family protein  31.25 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.89295  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3255  flagellar biosynthetic protein FlgN  28.79 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1797  hypothetical protein  31.31 
 
 		 143 aa  51.6  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2323  flagellar biosynthetic protein FlgN  30.69 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.697168  normal  0.220477 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004178  flagellar biosynthesis protein FlgN  30.61 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1298  FlgN  28.79 
 
 		 141 aa  46.2  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01279  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway chaperone  29.59 
 
 		 141 aa  45.4  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3092  FlgN family protein  28.35 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>