21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1301 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1301  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  409  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0857  hypothetical protein  50.57 
 
 		 199 aa  167  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0942  hypothetical protein  49.4 
 
 		 194 aa  159  3e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.971072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0992  hypothetical protein  46.43 
 
 		 196 aa  152  4e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00757119 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0748  hypothetical protein  47.71 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3639  hypothetical protein  44.44 
 
 		 208 aa  149  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.313555 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3697  hypothetical protein  43.89 
 
 		 208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.176724  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3821  hypothetical protein  43.89 
 
 		 208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.560519 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0808  hypothetical protein  47.06 
 
 		 179 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3231  hypothetical protein  44.74 
 
 		 201 aa  142  4e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3521  hypothetical protein  45.75 
 
 		 197 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3351  hypothetical protein  44.44 
 
 		 230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0602  hypothetical protein  43.79 
 
 		 230 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0662  hypothetical protein  44.38 
 
 		 202 aa  136  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.117194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2897  hypothetical protein  42.01 
 
 		 208 aa  135  4e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0634  hypothetical protein  45.39 
 
 		 205 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.536697  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1568  hypothetical protein  43.15 
 
 		 193 aa  108  5e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00113128  hitchhiker  0.0000220315 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2013  hypothetical protein  37.75 
 
 		 194 aa  96.3  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0205441  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0724  hypothetical protein  30.52 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000310173  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1740  hypothetical protein  38.2 
 
 		 379 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0126  hypothetical protein  32.94 
 
 		 204 aa  47.4  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>