20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1178 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1178  hypothetical protein  100 
 
 		 576 aa  1186    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1049  hypothetical protein  70.45 
 
 		 562 aa  804    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0715894  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03446  putative orphan protein  72.12 
 
 		 564 aa  780    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.27433  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4243  hypothetical protein  53.35 
 
 		 552 aa  613  9.999999999999999e-175  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1775  putative orphan protein  54.92 
 
 		 555 aa  597  1e-169  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4226  MutT/nudix family protein  35.38 
 
 		 599 aa  332  1e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.500357  normal  0.363608 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2237  MutT/NUDIX family protein  34.49 
 
 		 565 aa  318  1e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0855857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0483  MutT/nudix family protein  37.57 
 
 		 565 aa  318  2e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0516  MutT/NUDIX family protein  35.89 
 
 		 565 aa  318  2e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0511  MutT/NUDIX family protein  36.07 
 
 		 565 aa  317  4e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.203368  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2218  hypothetical protein  33.15 
 
 		 555 aa  306  7e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316012 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2502  hypothetical protein  35.76 
 
 		 545 aa  304  3.0000000000000004e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.233242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0528  MutT/NUDIX family protein  36.02 
 
 		 560 aa  301  3e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3447  Zn-dependent hydrolase  30.4 
 
 		 574 aa  286  5.999999999999999e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.453465 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07015  putative dipeptidyl-peptidase III  25.82 
 
 		 671 aa  80.1  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3161  hypothetical protein  23.2 
 
 		 664 aa  73.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3045  dipeptidyl-peptidase III  26.03 
 
 		 706 aa  68.9  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14113 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2965  hypothetical protein  22.18 
 
 		 668 aa  65.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.711778  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3053  hypothetical protein  23.12 
 
 		 664 aa  63.5  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0317  M49 family peptidase  21.58 
 
 		 886 aa  63.5  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.620339 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>