19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0927 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0927  hypothetical protein  100 
 
 		 608 aa  1254    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.943956  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4221  hypothetical protein  37.26 
 
 		 517 aa  329  7e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.256943 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0393  hypothetical protein  35.58 
 
 		 559 aa  325  1e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4062  hypothetical protein  37.5 
 
 		 548 aa  323  8e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3984  hypothetical protein  35.95 
 
 		 548 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3442  hypothetical protein  35.12 
 
 		 550 aa  320  5e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.325746  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4180  hypothetical protein  36.92 
 
 		 548 aa  318  2e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4093  hypothetical protein  36.73 
 
 		 548 aa  317  3e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.245434  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0276  hypothetical protein  34.01 
 
 		 561 aa  317  4e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0230  hypothetical protein  34.86 
 
 		 569 aa  317  5e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.769697  normal  0.583487 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3685  hypothetical protein  36.1 
 
 		 549 aa  316  8e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3877  hypothetical protein  36.29 
 
 		 546 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.413132  normal  0.0515255 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0306  hypothetical protein  36.08 
 
 		 503 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0272  hypothetical protein  36.1 
 
 		 546 aa  310  4e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3673  hypothetical protein  35.12 
 
 		 546 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3352  hypothetical protein  35.3 
 
 		 546 aa  298  3e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0379  hypothetical protein  33.83 
 
 		 543 aa  288  2e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0256  hypothetical protein  26.36 
 
 		 560 aa  149  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.17253  normal  0.370888 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0286  hypothetical protein  24.95 
 
 		 546 aa  134  6e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399443  hitchhiker  0.00000302702 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>