17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0511 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0511  hypothetical protein  100 
 
 		 229 aa  468  1.0000000000000001e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2038  hypothetical protein  38.04 
 
 		 351 aa  81.3  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0866  hypothetical protein  38.46 
 
 		 406 aa  76.6  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0582  hypothetical protein  40.45 
 
 		 354 aa  74.3  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4814  hypothetical protein  42.39 
 
 		 425 aa  72.8  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12173  hypothetical protein  33.04 
 
 		 361 aa  69.3  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3152  hypothetical protein  30.11 
 
 		 466 aa  61.2  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.416399 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4660  hypothetical protein  31.52 
 
 		 322 aa  58.9  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0582  hypothetical protein  28.57 
 
 		 378 aa  58.5  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0242426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2336  hypothetical protein  38.27 
 
 		 354 aa  58.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0899485  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6305  hypothetical protein  28.05 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1312  hypothetical protein  28.89 
 
 		 347 aa  57.4  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.667333 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2578  hypothetical protein  27.17 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.149067 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0075  hypothetical protein  33.77 
 
 		 343 aa  52.8  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1943  hypothetical protein  30.34 
 
 		 428 aa  52.4  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2453  hypothetical protein  21.43 
 
 		 233 aa  48.1  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.438658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0978  hypothetical protein  37.29 
 
 		 249 aa  46.6  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>