33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2517 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_2517  hypothetical protein  100 
 
 		 355 aa  726    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2831  hypothetical protein  98.03 
 
 		 355 aa  713    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0130  hypothetical protein  36.07 
 
 		 373 aa  173  5e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12530  hypothetical protein  33.91 
 
 		 349 aa  160  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1143  hypothetical protein  33.54 
 
 		 336 aa  150  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1276  hypothetical protein  30.81 
 
 		 356 aa  149  5e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1237  PEGA domain protein  30.1 
 
 		 613 aa  144  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0267  hypothetical protein  31.63 
 
 		 315 aa  143  4e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000104264  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0155  hypothetical protein  32.36 
 
 		 353 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.22307  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3047  hypothetical protein  29.79 
 
 		 331 aa  134  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0070521  normal  0.601156 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0640  PT repeat-containing protein  29.33 
 
 		 390 aa  130  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2113  hypothetical protein  30.38 
 
 		 331 aa  130  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2346  hypothetical protein  26.77 
 
 		 397 aa  126  6e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00115323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3732  hypothetical protein  28.72 
 
 		 384 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1532  PT repeat-containing protein  29.53 
 
 		 391 aa  120  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.679674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07280  hypothetical protein  29.04 
 
 		 362 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.776305  normal  0.0453221 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2290  PT repeat-containing protein  28.52 
 
 		 395 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0125565 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2608  hypothetical protein  28.47 
 
 		 419 aa  116  6.9999999999999995e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3134  PT repeat-containing protein  27.52 
 
 		 371 aa  112  8.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0529  hypothetical protein  27.56 
 
 		 376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.308782  hitchhiker  0.00891626 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3246  hypothetical protein  29.27 
 
 		 338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.678761  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0452  hypothetical protein  27.12 
 
 		 353 aa  105  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1400  secreted protein  25.33 
 
 		 364 aa  100  3e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2726  hypothetical protein  25.81 
 
 		 366 aa  100  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.534782  normal  0.106702 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6122  hypothetical protein  28.57 
 
 		 337 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105335  normal  0.402683 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1702  secreted protein  24.92 
 
 		 356 aa  84.7  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.417633  normal  0.0125499 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2104  hypothetical protein  24.23 
 
 		 373 aa  82  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.243869  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5211  hypothetical protein  28.03 
 
 		 355 aa  80.9  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1286  hypothetical protein  24 
 
 		 342 aa  80.1  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22930  hypothetical protein  23.53 
 
 		 328 aa  78.2  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.459753  normal  0.37663 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2070  hypothetical protein  25.09 
 
 		 334 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.379784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3416  hypothetical protein  20.96 
 
 		 359 aa  67.8  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000117428  hitchhiker  0.0000237376 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0173  hypothetical protein  18.77 
 
 		 357 aa  53.1  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.972629 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>