11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2428 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_2428  hypothetical protein  100 
 
 
133 aa  268  1e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2741  hypothetical protein  97.74 
 
 
133 aa  263  5.999999999999999e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1972  hypothetical protein  54.89 
 
 
132 aa  155  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0837  hypothetical protein  55.38 
 
 
131 aa  155  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000693731  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0339  hypothetical protein  50.38 
 
 
131 aa  149  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0891079  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1784  hypothetical protein  49.62 
 
 
131 aa  147  4e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000024243  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2364  hypothetical protein  50 
 
 
132 aa  135  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0214211  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0258  hypothetical protein  46.92 
 
 
132 aa  135  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000071805  normal  0.0664024 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0161  hypothetical protein  49.59 
 
 
132 aa  130  9e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.065813  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0184  hypothetical protein  44.62 
 
 
131 aa  123  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.104949  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0391  hypothetical protein  43.55 
 
 
130 aa  114  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000287347  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>