27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2198 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2492  putative ethanolamine utilization protein EutH  94.77 
 
 		 374 aa  662    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2198  ethanolamine utilization protein euth  100 
 
 		 363 aa  687    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.846609  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1057  Ethanolamine utilisation protein EutH  35.23 
 
 		 364 aa  207  3e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0902  ethanolamine utilization protein EutH  37.39 
 
 		 365 aa  202  5e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.348344  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2635  ethanolamine utilisation protein EutH  36.26 
 
 		 362 aa  196  4.0000000000000005e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0080  Ethanolamine utilisation protein EutH  34.38 
 
 		 370 aa  192  1e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2818  ethanolamine utilization protein EutH  34.93 
 
 		 408 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2598  ethanolamine utilization protein EutH  34.45 
 
 		 408 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3673  ethanolamine utilization protein EutH  34.65 
 
 		 408 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1225  ethanolamine utilisation protein EutH  34.45 
 
 		 408 aa  182  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2694  ethanolamine utilization protein EutH  34.37 
 
 		 408 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.720736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2729  ethanolamine utilization protein EutH  34.45 
 
 		 408 aa  182  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2580  ethanolamine utilization protein EutH  34.45 
 
 		 408 aa  182  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1218  Ethanolamine utilisation protein EutH  34.45 
 
 		 408 aa  182  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02343  predicted inner membrane protein  34.45 
 
 		 408 aa  181  2e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2653  ethanolamine utilization protein EutH  34.37 
 
 		 408 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.121668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2720  ethanolamine utilization protein EutH  34.37 
 
 		 408 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.741445  normal  0.29915 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2605  ethanolamine utilization protein EutH  34.37 
 
 		 408 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2827  ethanolamine utilization protein EutH  34.37 
 
 		 408 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02305  hypothetical protein  34.45 
 
 		 408 aa  181  2e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1238  ethanolamine utilisation protein, EutH  31.62 
 
 		 432 aa  176  5e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2048  ethanolamine utilisation protein, EutH  25.95 
 
 		 410 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3585  ethanolamine utilisation protein, EutH  25.8 
 
 		 398 aa  115  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2026  Ethanolamine utilization protein EutH  26.23 
 
 		 403 aa  113  4.0000000000000004e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.86347  hitchhiker  0.00000329746 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05800  ethanolamine utilization protein  24.59 
 
 		 402 aa  102  1e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0328304  hitchhiker  0.00312755 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45130  putative transporter  25.89 
 
 		 411 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2693  ethanolamine utilisation protein EutH  23.21 
 
 		 415 aa  96.7  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000770078  hitchhiker  0.00180508 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>