12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0760 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0760  ISCpe5, transposase  100 
 
 
88 aa  171  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000148485  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0187  ISCpe5, transposase  97.1 
 
 
521 aa  138  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0485  ISCpe5, transposase  97.1 
 
 
521 aa  138  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0165022  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0767  ISCpe5, transposase  98.11 
 
 
222 aa  104  4e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0429535  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1439  transposase IS4 family protein  44.59 
 
 
535 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2397  transposase ISNCY family protein  40 
 
 
534 aa  62.4  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000732775  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1024  transposase (08)  32.5 
 
 
175 aa  53.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2458  IS4 family transposase  35.14 
 
 
517 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000853603  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1874  transposase IS4 family protein  31.65 
 
 
227 aa  52  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1154  transposase IS4 family protein  31.88 
 
 
486 aa  44.7  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.543034  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0575  transposase IS4 family protein  28 
 
 
547 aa  42.7  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000022159  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0153  transposase IS4 family protein  28 
 
 
557 aa  42.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000196095  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>