12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0365 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0365  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  257  3e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0368  hypothetical protein  96.21 
 
 
132 aa  244  2e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.967507  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1123  hypothetical protein  36.67 
 
 
128 aa  90.9  6e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000270021  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1196  protein of unknown function DUF125 transmembrane  29.27 
 
 
285 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.679365 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1173  protein of unknown function DUF125 transmembrane  30.36 
 
 
293 aa  48.1  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0215  protein of unknown function DUF125 transmembrane  27.27 
 
 
300 aa  47  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1685  protein of unknown function DUF125 transmembrane  32.29 
 
 
289 aa  45.4  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1049  hypothetical protein  28.1 
 
 
293 aa  45.4  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0860  hypothetical protein  31.45 
 
 
293 aa  44.3  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.110107  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0912  protein of unknown function DUF125 transmembrane  25 
 
 
291 aa  41.6  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0423  hypothetical protein  27.42 
 
 
284 aa  40.8  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0438  hypothetical protein  27.42 
 
 
284 aa  40.8  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>