33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2831 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_2517  hypothetical protein  98.03 
 
 
355 aa  713    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2831  hypothetical protein  100 
 
 
355 aa  724    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0130  hypothetical protein  35.71 
 
 
373 aa  171  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12530  hypothetical protein  33.91 
 
 
349 aa  159  5e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1143  hypothetical protein  33.65 
 
 
336 aa  153  5e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1276  hypothetical protein  31.36 
 
 
356 aa  150  3e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1237  PEGA domain protein  30.8 
 
 
613 aa  144  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0267  hypothetical protein  31.63 
 
 
315 aa  144  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000104264  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0155  hypothetical protein  32.36 
 
 
353 aa  137  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.22307  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3047  hypothetical protein  29.79 
 
 
331 aa  133  5e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0070521  normal  0.601156 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0640  PT repeat-containing protein  29.33 
 
 
390 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2113  hypothetical protein  30.03 
 
 
331 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2346  hypothetical protein  26.77 
 
 
397 aa  124  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00115323  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07280  hypothetical protein  29.37 
 
 
362 aa  118  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.776305  normal  0.0453221 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3732  hypothetical protein  28.86 
 
 
384 aa  117  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1532  PT repeat-containing protein  29.19 
 
 
391 aa  117  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.679674  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3134  PT repeat-containing protein  27.85 
 
 
371 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2290  PT repeat-containing protein  28.19 
 
 
395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0125565 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2608  hypothetical protein  28.14 
 
 
419 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0529  hypothetical protein  27.56 
 
 
376 aa  110  3e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.308782  hitchhiker  0.00891626 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3246  hypothetical protein  28.92 
 
 
338 aa  108  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.678761  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0452  hypothetical protein  26.49 
 
 
353 aa  103  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1400  secreted protein  25.33 
 
 
364 aa  99  1e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2726  hypothetical protein  25.81 
 
 
366 aa  97.8  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.534782  normal  0.106702 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6122  hypothetical protein  28.57 
 
 
337 aa  94.4  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105335  normal  0.402683 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1702  secreted protein  24.92 
 
 
356 aa  86.7  6e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.417633  normal  0.0125499 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22930  hypothetical protein  23.91 
 
 
328 aa  82.8  0.000000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.459753  normal  0.37663 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5211  hypothetical protein  28.03 
 
 
355 aa  82.4  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159445  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2104  hypothetical protein  24.66 
 
 
373 aa  81.6  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.243869  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1286  hypothetical protein  24.64 
 
 
342 aa  79.3  0.00000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2070  hypothetical protein  25.44 
 
 
334 aa  75.9  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.379784  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3416  hypothetical protein  20.96 
 
 
359 aa  68.9  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000117428  hitchhiker  0.0000237376 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0173  hypothetical protein  18.35 
 
 
357 aa  51.6  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.972629 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>