14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1141 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1141  hypothetical protein  100 
 
 		 228 aa  454  1e-127  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0173277  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2178  hypothetical protein  55.26 
 
 		 228 aa  267  8e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.303816  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1407  hypothetical protein  54.19 
 
 		 228 aa  259  3e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1595  hypothetical protein  50.88 
 
 		 228 aa  253  1.0000000000000001e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00605594 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0249  hypothetical protein  53.95 
 
 		 228 aa  253  2.0000000000000002e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1304  hypothetical protein  52.68 
 
 		 224 aa  239  4e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.795946  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0701  hypothetical protein  48.43 
 
 		 224 aa  217  1e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1555  hypothetical protein  34.09 
 
 		 231 aa  124  2e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0170408  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4918  hypothetical protein  24.12 
 
 		 299 aa  62.4  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0240  hypothetical protein  26.55 
 
 		 260 aa  58.2  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.659958  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1815  VTC domain protein  24.57 
 
 		 319 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.235458 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2305  hypothetical protein  25.52 
 
 		 242 aa  48.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310483  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3169  hypothetical protein  23.04 
 
 		 280 aa  44.3  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2978  hypothetical protein  27.91 
 
 		 227 aa  42.4  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>