12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0333 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0333  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  251  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00389128  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2420  hypothetical protein  41.5 
 
 		 147 aa  93.6  9e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000357278  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2519  hypothetical protein  38.41 
 
 		 138 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0110304 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2642  hypothetical protein  31.29 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.660176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06880  hypothetical protein  43.75 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0587  hypothetical protein  35.45 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_526  hypothetical protein  35.45 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000558785  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1214  hypothetical protein  30.88 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000175016  normal  0.800065 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0561  hypothetical protein  37.27 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00605837  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4062  hypothetical protein  28.4 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3352  hypothetical protein  31.33 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2432  hypothetical protein  23 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.304675  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>