18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND04480 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006686  CND04480  structural constituent of ribosome, putative  100 
 
 		 172 aa  339  1e-92  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.287785  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09097  37S ribosomal protein S24 (AFU_orthologue; AFUA_7G02140)  58.46 
 
 		 133 aa  154  5.0000000000000005e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.133794  normal  0.364425 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_42986  Ribosomal protein S24, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  59.35 
 
 		 130 aa  147  6e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.127832  normal  0.243183 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87922  ribosomal protein S24  59.83 
 
 		 135 aa  140  8e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21323  predicted protein  52.85 
 
 		 137 aa  129  1.0000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0565  Ribosomal protein S24e  41.18 
 
 		 99 aa  67  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0448  ribosomal protein S24e  32.98 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2222  30S ribosomal protein S24e  27.71 
 
 		 113 aa  49.7  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000329506 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1895  30S ribosomal protein S24e  34.44 
 
 		 123 aa  47  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0282  30S ribosomal protein S24e  34.07 
 
 		 101 aa  46.2  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1324  ribosomal protein S24e  31.76 
 
 		 99 aa  45.4  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0283  30S ribosomal protein S24e  32.94 
 
 		 102 aa  44.7  0.0006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.568514  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1197  30S ribosomal protein S24e  35.56 
 
 		 135 aa  44.7  0.0006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1438  30S ribosomal protein S24e  31.76 
 
 		 121 aa  44.3  0.0008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.109359  normal  0.0262795 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2245  ribosomal protein S24e  35.37 
 
 		 97 aa  42.7  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0242  SSU ribosomal protein S24E  39.73 
 
 		 99 aa  42.4  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1956  30S ribosomal protein S24e  30.49 
 
 		 103 aa  42.4  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1194  30S ribosomal protein S24e  34.62 
 
 		 102 aa  40.8  0.01  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>