14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC06540 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006685  CNC06540  conserved hypothetical protein  100 
 
 
301 aa  624  1e-178  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06550  expressed protein  36.86 
 
 
312 aa  177  2e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38512  dihydrofolate reductase  25.79 
 
 
265 aa  79.3  0.00000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.279058 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92087  predicted protein  29.18 
 
 
236 aa  70.9  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60284  dihydrofolate reductase  24.81 
 
 
278 aa  68.6  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.01153 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04776  dihydrofolate reductase (AFU_orthologue; AFUA_3G06620)  30.6 
 
 
243 aa  58.9  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38917  predicted protein  23.69 
 
 
287 aa  55.8  0.0000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27035  predicted protein  27.43 
 
 
247 aa  52  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000203878  normal  0.0103977 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42744  predicted protein  29.53 
 
 
301 aa  47.4  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.276134  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11117  DUF341 family oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01420)  33.09 
 
 
214 aa  45.1  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11156  conserved hypothetical protein  38.03 
 
 
353 aa  44.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15249  predicted protein  32.5 
 
 
206 aa  44.3  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1699  AMP-dependent synthetase and ligase  25.54 
 
 
1433 aa  45.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03494  conserved hypothetical protein  24.31 
 
 
437 aa  44.3  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>