35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1218 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1218  flagellar assembly protein FliW  100 
 
 
129 aa  259  8e-69  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.462259  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1093  flagellar assembly protein FliW  100 
 
 
129 aa  259  8e-69  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.112055  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0648  flagellar assembly protein FliW  99.22 
 
 
129 aa  258  2e-68  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.486344  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0959  flagellar assembly protein FliW  67.44 
 
 
131 aa  186  8e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.67703  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1068  flagellar assembly protein FliW  52.71 
 
 
128 aa  142  2e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.253776  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1960  flagellar assembly protein FliW  49.61 
 
 
127 aa  133  9e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1592  flagellar assembly protein FliW  49.61 
 
 
127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0858  protein of unknown function DUF180  46.51 
 
 
130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0412  flagellar assembly protein FliW  38.76 
 
 
126 aa  82.4  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1670  flagellar assembly protein FliW  39.33 
 
 
152 aa  76.3  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2240  flagellar assembly protein FliW  35.23 
 
 
159 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.268848  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0098  flagellar assembly protein FliW  29.36 
 
 
148 aa  62  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0454  flagellar assembly protein FliW  37.5 
 
 
165 aa  61.2  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0247  flagellar assembly protein FliW  31.78 
 
 
142 aa  58.5  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3027  flagellar assembly protein FliW  32.71 
 
 
144 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2354  flagellar assembly protein FliW  30.48 
 
 
147 aa  57.8  0.00000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2416  hypothetical protein  33.33 
 
 
136 aa  56.2  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1619  protein of unknown function DUF180  27.93 
 
 
135 aa  56.6  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4192  protein of unknown function DUF180  35.23 
 
 
152 aa  56.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3225  flagellar assembly protein FliW  36.26 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1512  flagellar assembly protein FliW  32.14 
 
 
146 aa  55.5  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0749  hypothetical protein  29.36 
 
 
158 aa  55.1  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.746617 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0391  hypothetical protein  30.43 
 
 
157 aa  53.9  0.0000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0441  flagellar assembly protein FliW  30.28 
 
 
153 aa  53.5  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17100  hypothetical protein  36.36 
 
 
156 aa  53.1  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0670  protein of unknown function DUF180  32.17 
 
 
159 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0326033 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1620  protein of unknown function DUF180  28.83 
 
 
136 aa  49.3  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0613  protein of unknown function DUF180  30.28 
 
 
152 aa  47.4  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0771  hypothetical protein  25.45 
 
 
135 aa  47.8  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0081  hypothetical protein  31.4 
 
 
162 aa  44.7  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.171449 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0830  hypothetical protein  29.07 
 
 
145 aa  44.7  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.258231  normal  0.70699 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0667  protein of unknown function DUF180  27.1 
 
 
159 aa  43.9  0.0008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0195  hypothetical protein  25 
 
 
156 aa  42.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2233  flagellar assembly protein FliW  29.21 
 
 
151 aa  42  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000631817 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0866  flagellar assembly protein FliW  25.69 
 
 
149 aa  42  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>