14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3793 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_3793  hypothetical protein  100 
 
 
291 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.588351  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2037  Naringenin-chalcone synthase  62.89 
 
 
656 aa  370  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.629301  normal  0.879643 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2097  UbiA prenyltransferase  38.97 
 
 
288 aa  209  5e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2533  UbiA prenyltransferase  39.22 
 
 
285 aa  185  6e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.117462 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1300  UbiA prenyltransferase  27.43 
 
 
294 aa  88.2  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2047  UbiA prenyltransferase  28.57 
 
 
287 aa  51.2  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1089  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  22.98 
 
 
333 aa  50.8  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0279  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25.71 
 
 
302 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0728517  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1922  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25.71 
 
 
302 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1155  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.23 
 
 
376 aa  43.5  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.142622  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1390  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  21.98 
 
 
334 aa  43.1  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.937819  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0911  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  23.47 
 
 
300 aa  42.7  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.714122 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1105  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  21.52 
 
 
299 aa  42.4  0.009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.359039  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1719  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.57 
 
 
297 aa  42.4  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.641378  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>