43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3670 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5651  GH3 auxin-responsive promoter  56.46 
 
 		 507 aa  642    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3419  GH3 auxin-responsive promoter  57.52 
 
 		 504 aa  644    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000537388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3670  auxin-regulated protein  100 
 
 		 504 aa  1057    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3685  GH3 auxin-responsive promoter  54.4 
 
 		 502 aa  611  9.999999999999999e-175  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.46637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0752  GH3 auxin-responsive promoter  51.9 
 
 		 502 aa  566  1e-160  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0869  GH3 auxin-responsive promoter  51.72 
 
 		 510 aa  565  1e-160  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1713  GH3 auxin-responsive promoter  52.77 
 
 		 507 aa  553  1e-156  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1338  hypothetical protein  51 
 
 		 508 aa  548  1e-155  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00655  putative plant auxin-regulated protein  50.73 
 
 		 484 aa  534  1e-150  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1720  hypothetical protein  46.95 
 
 		 509 aa  492  9.999999999999999e-139  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0190  GH3 auxin-responsive promoter  36.77 
 
 		 495 aa  350  2e-95  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.210438  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02895  putative auxin-regulated protein  37.45 
 
 		 497 aa  347  2e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.380392  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1025  GH3 auxin-responsive promoter  35.43 
 
 		 494 aa  328  1.0000000000000001e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5924  GH3 auxin-responsive promoter  35.23 
 
 		 500 aa  317  4e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3178  GH3 auxin-responsive promoter  34.34 
 
 		 510 aa  313  4.999999999999999e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2048  GH3 auxin-responsive promoter  35 
 
 		 497 aa  312  7.999999999999999e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3833  GH3 auxin-responsive promoter  34.11 
 
 		 500 aa  306  5.0000000000000004e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.723154  normal  0.130127 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2997  auxin-regulated protein  35.76 
 
 		 496 aa  302  1e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0949  GH3 auxin-responsive promoter  33.47 
 
 		 514 aa  295  1e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.424251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0805  auxin-responsive GH3-related protein  33.47 
 
 		 514 aa  295  1e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0468  hypothetical protein  34.21 
 
 		 502 aa  291  1e-77  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1664  GH3 auxin-responsive promoter  32.71 
 
 		 514 aa  274  3e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.714218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0473  GH3 auxin-responsive promoter  33.47 
 
 		 521 aa  271  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0144  GH3 auxin-responsive promoter  30.08 
 
 		 522 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1029  GH3 auxin-responsive promoter  31.58 
 
 		 510 aa  261  2e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00063016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2660  auxin-regulated like  35.15 
 
 		 512 aa  259  1e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0118  GH3 auxin-responsive promoter  31.03 
 
 		 508 aa  244  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.086469 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1092  GH3 auxin-responsive promoter family protein  30.77 
 
 		 562 aa  239  9e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0359437  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1478  GH3 auxin-responsive promoter  30.52 
 
 		 527 aa  233  5e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.173313 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0617  GH3 auxin-responsive promoter  30.74 
 
 		 528 aa  227  3e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12318  hypothetical protein  29.25 
 
 		 507 aa  222  9.999999999999999e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0495  GH3 auxin-responsive promoter  28.24 
 
 		 528 aa  220  5e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5682  normal  0.527563 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1855  GH3 auxin-responsive protein  28.16 
 
 		 530 aa  216  9e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2573  GH3 auxin-responsive promoter  29.01 
 
 		 539 aa  209  8e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0953  GH3 auxin-responsive promoter  24.1 
 
 		 586 aa  108  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0561894  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2981  GH3 auxin-responsive promoter  26.12 
 
 		 557 aa  107  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4770  GH3 auxin-responsive promoter  22.12 
 
 		 581 aa  88.2  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0973169  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1675  GH3 auxin-responsive promoter  29.13 
 
 		 559 aa  77  0.0000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2824  auxin-responsive GH3-related protein  23.33 
 
 		 487 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0537258  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1542  hypothetical protein  33.71 
 
 		 128 aa  61.6  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2698  GH3 auxin-responsive promoter  25.99 
 
 		 417 aa  56.6  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.797778  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4515  GH3 auxin-responsive promoter  30 
 
 		 526 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0740  auxin-responsive GH3-related protein  29.9 
 
 		 532 aa  53.5  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.128908 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>