22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3661 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_3661  hypothetical protein  100 
 
 
155 aa  314  3e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0897  hypothetical protein  47.1 
 
 
154 aa  145  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00141206 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5793  hypothetical protein  39.35 
 
 
154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4139  hypothetical protein  41.94 
 
 
152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.24606  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2548  hypothetical protein  38.56 
 
 
152 aa  105  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3775  hypothetical protein  33.99 
 
 
155 aa  94.7  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0018527  hitchhiker  0.00917662 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1159  hypothetical protein  36.43 
 
 
144 aa  89.7  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2555  hypothetical protein  37.06 
 
 
142 aa  88.6  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.356982  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3253  hypothetical protein  35.62 
 
 
139 aa  85.5  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0930132 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2059  hypothetical protein  30.72 
 
 
155 aa  80.9  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.535372  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6869  hypothetical protein  33.79 
 
 
165 aa  80.5  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.640003  normal  0.119892 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0815  hypothetical protein  29.45 
 
 
158 aa  79.3  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000351939 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02620  hypothetical protein  32.12 
 
 
147 aa  79  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0737  hypothetical protein  33.8 
 
 
140 aa  78.2  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4463  hypothetical protein  29.22 
 
 
157 aa  77.8  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235508  normal  0.0116174 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0181  hypothetical protein  35.95 
 
 
147 aa  77.8  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.000000000752164  normal  0.677539 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0396  hypothetical protein  32.87 
 
 
147 aa  76.6  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1779  hypothetical protein  32.03 
 
 
155 aa  68.9  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155662  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4171  hypothetical protein  35.94 
 
 
147 aa  65.9  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000102963  hitchhiker  0.000000290643 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0023  hypothetical protein  32.03 
 
 
146 aa  59.7  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0746  hypothetical protein  29.41 
 
 
144 aa  55.5  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1109  hypothetical protein  26.4 
 
 
139 aa  51.6  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000177487  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>