43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2997 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5924  GH3 auxin-responsive promoter  64.08 
 
 		 500 aa  667    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3833  GH3 auxin-responsive promoter  64.15 
 
 		 500 aa  669    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.723154  normal  0.130127 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2997  auxin-regulated protein  100 
 
 		 496 aa  1020    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2048  GH3 auxin-responsive promoter  61.43 
 
 		 497 aa  630  1e-179  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0468  hypothetical protein  59.11 
 
 		 502 aa  608  1e-173  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3178  GH3 auxin-responsive promoter  57.72 
 
 		 510 aa  600  1e-170  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1025  GH3 auxin-responsive promoter  57.43 
 
 		 494 aa  600  1e-170  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02895  putative auxin-regulated protein  54.58 
 
 		 497 aa  587  1e-166  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.380392  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0190  GH3 auxin-responsive promoter  55.74 
 
 		 495 aa  585  1e-166  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.210438  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5651  GH3 auxin-responsive promoter  37.85 
 
 		 507 aa  321  1.9999999999999998e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00655  putative plant auxin-regulated protein  37.13 
 
 		 484 aa  320  3e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1713  GH3 auxin-responsive promoter  35.71 
 
 		 507 aa  316  6e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0752  GH3 auxin-responsive promoter  35.14 
 
 		 502 aa  315  9.999999999999999e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0869  GH3 auxin-responsive promoter  38.72 
 
 		 510 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1720  hypothetical protein  38.36 
 
 		 509 aa  306  4.0000000000000004e-82  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3419  GH3 auxin-responsive promoter  35.97 
 
 		 504 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000537388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3685  GH3 auxin-responsive promoter  37.08 
 
 		 502 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.46637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1338  hypothetical protein  35.43 
 
 		 508 aa  302  1e-80  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0949  GH3 auxin-responsive promoter  36.17 
 
 		 514 aa  291  2e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.424251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0805  auxin-responsive GH3-related protein  36.17 
 
 		 514 aa  291  2e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3670  auxin-regulated protein  35.76 
 
 		 504 aa  290  4e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0144  GH3 auxin-responsive promoter  32.72 
 
 		 522 aa  276  4e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1664  GH3 auxin-responsive promoter  33.75 
 
 		 514 aa  250  5e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.714218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2660  auxin-regulated like  36.61 
 
 		 512 aa  248  2e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1092  GH3 auxin-responsive promoter family protein  31.89 
 
 		 562 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0359437  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1029  GH3 auxin-responsive promoter  33.05 
 
 		 510 aa  234  3e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00063016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0473  GH3 auxin-responsive promoter  32.56 
 
 		 521 aa  234  4.0000000000000004e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0118  GH3 auxin-responsive promoter  30.54 
 
 		 508 aa  231  3e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.086469 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12318  hypothetical protein  31.26 
 
 		 507 aa  226  1e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1478  GH3 auxin-responsive promoter  29.42 
 
 		 527 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.173313 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1855  GH3 auxin-responsive protein  29.9 
 
 		 530 aa  206  7e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0495  GH3 auxin-responsive promoter  28.93 
 
 		 528 aa  206  7e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5682  normal  0.527563 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0617  GH3 auxin-responsive promoter  29.07 
 
 		 528 aa  205  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2573  GH3 auxin-responsive promoter  29.35 
 
 		 539 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1675  GH3 auxin-responsive promoter  24.05 
 
 		 559 aa  116  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0953  GH3 auxin-responsive promoter  24.67 
 
 		 586 aa  87.8  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0561894  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1542  hypothetical protein  37.89 
 
 		 128 aa  76.6  0.0000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2824  auxin-responsive GH3-related protein  21.79 
 
 		 487 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0537258  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0740  auxin-responsive GH3-related protein  26.71 
 
 		 532 aa  51.2  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2981  GH3 auxin-responsive promoter  29.17 
 
 		 557 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4515  GH3 auxin-responsive promoter  31.03 
 
 		 526 aa  47.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0301  vibriobactin-specific 2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  25.51 
 
 		 543 aa  45.1  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4770  GH3 auxin-responsive promoter  29.76 
 
 		 581 aa  44.3  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0973169  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>